BioEmu2_生物分子结构与动力学的基础模型.pdfVIP

在结构生物学与计算医药领域，研究人员长期面临着一个核心矛盾：以AlphaFold为代表的传统折叠模型虽然

极其精准，但给出的往往只是尖锐、单一的“静态快照”(Snapshot);而生命活动的本质却是高度柔性与动态

的(FHexible)。如果改用传统的全原子分子动力学(MD)模拟去捕捉这种动态，往往需要消耗数周甚至数年

的GPU算力。

为了填补“静态结构预测”与“高昂动力学模拟”之间的鸿沟，微软研究院AIforScience团队(FrankNoe领衔)推

出了全面进化的第二代生物分子基础模型—BioEmu2。

不同于传统的MD模拟或者结构预测模型，BioEmu2将“静态结构预测”、“热力学平衡态采样”、“跨时间尺度动

力学推演”以及“万级残基超大复合物装配”四大核心功能融为一体，构建了一套完整的生物分子模拟工作流。

一、功能基石：全分子类型的SOTA静态结构预测

“生物分子的三维结构是一切动力学演化的基础。”在深入动态模拟之前，一个合格的基座模型必须首先具备顶

级的静态折叠能力。

在结构预测模式(Structurepredictionmode)下，BioEmu2展现出了不错的能力。在采用完全相同的训练与测试

集划分标准下，其预测精度全