三代序列比对并行优化算法研究.pdf

摘要

摘要

序列比对是生物信息领域重要的源头工作,通过比较遗传物质中最小信息

单元的排列特征,研究序列对于生命内部物质结构和功能的决定性意义,为后续

生物学各分支学科研究提供数据支撑。测序技术历经三代发展,第三代测序技术

克服了前代技术的缺点,在测序读长和测序速度方面取得重大突破,测序成本不

断降低,序列数据规模不断增大。迅速增大的序列文件规模对序列比对工作提出

了严峻挑战,传统串行比对程序无法满足如此庞大的数据处理需求,目前的

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