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2017-09-29 发布于江苏
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[分子数量遗传学课件]leture11 Association study.pdf

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[分子数量遗传学课件]leture11 Association study.pdf

Association study linkage disequilibriumLD case-control study LD Association between 2 alleles located family-based test near each other on a chromosome,such that (trios) (sibships) they are inherited together more frequently (extend pedigree) than expected by chance Marker A (A A ),B(B ,B ), Possible haploptypes are 1 2 1 2 A B , A B , A B ,A B 1 1 2 1 2 1 2 2 if frequencies of alleles all =0.5, expect frequencies of each haplotypes to be 0.25 any departure from 0.25 is linkage disequilibrium 1 (Case-control) Controls Cases 6/2 6/6 3/5 3/4 2/4 3/6 5/6 3/2 3/6 4/6 2/6 6/6 2/6