浅谈生物活性分子的结构特点.pdfVIP

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浅谈生物活性分子的结构特点 王宇陈浩黄彬周南 ?什么是生物活性分子 ?什么是生物活性分子 核酸 核酸 多肽 蛋白质 多肽 蛋白质 酶 单氨基酸 激素 酶 单氨基酸 激素 NO CO NO CO H2S H2S 生物活性分子的共同特点: 生物活性分子的共同特点: 高度选择性 高度选择性 自组织性 自组织性 可调性 可调性 高效性 高效性 • 生物活性分子的结构基础: • 生物活性分子的结构基础: • 1.不对称因素 • 1.不对称因素 • 2. 弱相互作用 • 2. 弱相互作用 • 3.金属离子活性中心 • 3.金属离子活性中心 • 1、立体结构 • 提到反应停,没有人会陌生。 反应停产品为外消旋体。其中R型为有 效成分,而S型却为致畸剂。 • 手性针对小分子而言, 是由原子团空间相对位置不同引起的 • 类似的,有活性的生物大分子往往保 持着特定的立体结构 • 蛋白质特定的空间构象是由氢键、 离子键、偶极与偶极间的相互作用、疏 水作用等作用力维持的,疏水作用是主 要的作用力。有些蛋白质还涉及到二硫 键。 • 蛋白质的折叠是有序的、由疏水作 用力推动的的协同过程。伴侣分子在蛋 白质的折叠中起着辅助性的作用。蛋白 质多肽链在生理条件下折叠成特定的构 象是热力学上的一种有利的过程。 磷酸丙糖异构酶和丙酮酸激酶的三级结构 • 蛋白质分子经过折叠,多肽链上有 些相距甚远的基团变得近在咫尺,从而 相互影响。整个分子具有了特定的空间 结构,只能与特定的底物发生反应。 生物体本身就是一个不对称 生物体本身就是一个不对称 环境,很多生化反应的高度选择 环境,很多生化反应的高度选择 性正是基于对不对称分子结构的 性正是基于对不对称分子结构的 特异性识别。反应停的惨剧揭示 特异性识别。反应停的惨剧揭示 了:生物体是十分精密的,同时 了:生物体是十分精密的,同时 也是十分脆弱的! 也是十分脆弱的! • 2、弱相互作用 • 弱相互作用就是强度不及共价键的 一类作用力总称,包括配位基团、亲水 疏水基团、带电/可离子化基团、氢键供 体/受体之间的作用力. 。 每种离子通道只可以特异性选择某种半 径合适的离子通过,其它离子则因为能量原因 不能通过. 离子进出离子通道的过程是一个离子与水分 子配位——与蛋白质配位——与水分子配位 的过程。与离子通道半径相适合的离子,其 分别与水分子和蛋白质配合所产生的焓变相 近,能顺利从水合状态转变到与蛋白质配合 状态从而进入离子通道。 钾离子通道 肌红蛋白在生物体内起着储存氧和促进氧 在细胞中扩散的作用。 肌红蛋白是由含153 个氨基酸残 基的多肽链与一个血红素组成,血红素 位于多肽链的一个沟缝中,其周围被氨 基酸残基的疏水性侧链所包围。 • 简单以水为配体的Fe ( Ⅱ)很容易被 氧化,但在血红蛋白中,Fe ( Ⅱ)可以与 氧直接结合而不发生氧化. 虽然弱相互作用力强度远不及共 虽然弱相互作用力强度远不及共 价键,但也正因为如此它能迅速 价键,但也正因为如此它能迅速 生成又迅速断裂

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