《动物遗传学》08动物基因组的基础.docVIP

第八章、动物基因组的基础 第一节 基因组学的概况 一、概念： 1、基因组学（genomics）：研究生物体全基因组的分子结构和遗传功能的学科称基因组（genomics）。 2、结构基因组学（structural genomics）：以分析测定基因组核苷酸序列为主要目的的基因组研究； 3、功能基因组学（functional genomics）：研究全基因组的基因及其功能，又叫后基因组学（post-genomics）。 4、比较基因组学：通过模式生物基因组之间、动物基因组之间以及模式生物基因组、动物基因组及人类基因组间的比较与鉴别，为研究生物进化、分离动物生产中的经济性状的候选基因、以及预测新的基因提供依据。 二、基因组计划（genome project)： 研究一个基因组的全部工作的规划： 1.测定全部DNA序列； 2.构建基因组的物理图谱； 3.构建基因组的遗传图谱； 4.构建基因组的转录图谱； 5.分析基因组的功能。 三、目前实施的基因组计划： 1、微生物：大肠杆菌、噬菌体、酵母 2、植物：拟南芥、水稻； 3、动物：果蝇、猪、牛、鸡等； 人。 四、HGP的目标 1. Generate sets of full-length cDNA clones and sequences that represent human genes and model organisms. （分析出代表人类全部基因和模式生物的全长cDNA克隆和序列）。 2. Support research on methods for studying functions of nonprotein-coding sequences（产生一种方法用来研究非蛋白编码序列的功能）。 3. Develop technology for comprehensive analysis of gene expression（研究一些技术用来理解和分析基因的表达）。 4. Improve methods for genome-wide mutagenesis（研究一些技术用来研究整个基因组的突变产生）。 5. Develop technology for large-scale protein analyses. 第二节 动物遗传标记 一、遗传标记的发展 1、形态学水平 优点： 形态学来检测遗传变异是最简单易行的方法 表型和基因型之间存在着密切的相关性，根据表型性状上的差异来反映基因型上的差异检测遗传变异的常用手段 动植物的分类学研究也多以形态学表型性状的差异作分类标准 表型性状研究遗传多样性具有方便快速的特点 缺点： 主要是符合孟德尔定律德的一些单基因性状（质量性状），仅代表生物基因组中的极少数基因，因而此类标记不能对整个基因组进行研究，所以不能全面地反应生物体的遗传多样性水平 另外，由于表型性状经常会受环境因素的影响而发生变化，而有些变化并不能真实反映遗传变异。要更加准确、细致的了解种群的遗传变异状况，仅仅依赖表型性状是不够，还必须进行更深层次的研究，并加以比较和验证 2、细胞学水平 细胞遗传标记主要是指染色体的核型、带型和数量特征的变异等，反映了染色体在结构和数量上的遗传多样性。 呈孟德尔式遗传，大多表现在染色体高度重复的异染色质所在部位。 核型分析 ： 带型分析 ： 染色体行为分析 ： 原位杂交技术 ： 3、蛋白质水平 （1） 血清学方法 （2）蛋白质和同工酶 ： 蛋白质是基因表达的产物，经历了从遗传信息的转录、mRNA的编辑加工、翻译、蛋白质一级结构的成熟和空间构象的形成过程，其表现易受环境和发育状况的影响。另外，蛋白质电泳能检测到的基因位点数受现行电泳和染色方法所限，常用的酶系统一般30个左右，最多不超过60个，而且并非所有的氨基酸变异都能通过电泳反映出来，并且编码蛋白基因的DNA序列的无意突变也无法检测到，因而有时会低估群体的遗传多样性程度。 酸水平的遗传多样性 核酸（DNA，RNA）作为生物的第一、二级信息分子，是生物遗传变异和生长发育的信息源泉，DNA是遗传信息的载体，分子水平的遗传多样性产生于DNA核苷酸序列的差异因而从核酸水平研究群体遗传多样性是最准确、最直接的方法 二、遗传标记 1． RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism, 限制性片段长度多态性) DNA限制性片段长度多态性(RFLP)：是指用限制性内切酶处理不同生物个体的DNA所产生的大分子片段的大小差异。这一标记系统是Bostein和White等（1980）提出的，也是最早的DNA分子标记。 基本原理是，生物在长期进化的过程中，会在种、属甚至品种间同源DNA序列的限制性内切酶识别位点上出现差异，在酶切作用下会产生