Bio-Plex悬液芯片技术在生命科学与医学研究中的应用.pdfVIP

Bio-Plex悬液芯片技术在生命科学与医学研究中的应用 2.1 Bio-Plex悬液芯片技术应用概述 悬液芯片技术自发明以来的十几年中主要应用于三个领域：基因组学、蛋白质组学和临床诊断检测。在 蛋白质组学领域的应用，悬液芯片技术显示出其巨大的优势，其操作与免疫检测技术（ELISA）几乎相同，已 经广泛应用于蛋白质的表达谱，蛋白质翻译后修饰如磷酸化、糖基化，以及对蛋白质功能和相互作用的筛查 的研究中，主要领域有各种疾病、生理过程的细胞因子表达谱分析、聚焦蛋白质组学（focused proteomics） 研究、转化医学、病理与药理和新药筛选等。在核酸检测方面，平板的DNA芯片技术广泛的用于高通量基因表 达的平行分析，但是由于一些特殊的DNA应用的出现，研究的范围可能仅限于某一类功能基因组，如某一类疾 病的研究、SNP分析验证、病原体检测、micro RNA等，这类应用显然无需巨大通量的DNA固相芯片，而液相芯 片更加合适，操作更加简便，芯片组的选择也更加灵活。而在临床诊断领域，悬液芯片是很好的疾病筛查、 诊断和监控的工具，现已有广泛的应用，包括呼吸道病原体、肠道疾病病原体的筛查和检测，和一些疾病标 志物的检测等等。关于悬液芯片技术在各领域的应用，详细如下表所示： Bio-Plex悬液芯片技术的应用 基因组学（Genomics） 基因分型（Genotyping） 基于寡核苷酸微球的悬液芯片技术是高效率高通量的SNP分析平台（Ye et al. 2001）； - 基因多态性分析 也是进行寡核苷酸配基检测（lannone et al. 2000），单碱基突变分析（Chen et al. - 基因突变分析 2000），以及聚合酶介导的寡核苷酸单碱基延伸检测（Cai et al. 2000）的有效手段； 也证明该技术是进行疾病特异性突变分析的有效手段（(Dunbar and Jacobson 2000, Ward et al. 2002)。 基因表达（Gene Expression） 悬液芯片技术最适合进行较小通量的多重基因检测，如单次反应在100个以内，这只需 - 疾病标志物 要1小时即可完成96个样品的多重检测。 - 发育过程 - 基因调控 蛋白质组学（Proteomics） 蛋白表达谱分析（Protein 对刺激和非刺激细胞、检验组和对照组的细胞因子定量分析已经是悬液芯片技术最普 Profiling） 遍的应用。这些因子，包括细胞因子、趋化因子、生长因子和脂肪因子等，是一群细 - 多重细胞因子检测 胞信号蛋白，对这些蛋白的同步检测能揭示细胞、组织或机体免疫反应的复杂机理。 （Carson and Vignali 1999, de Jager et al. 2003). 翻译后修饰 同步检测细胞内多重磷酸化蛋白是理解胞内信号转导所必需的，使用悬液芯片技术是 细胞信号转导蛋白 更加高效的磷酸化蛋白的检测手段。(Gao et al. 2003) 蛋白功能与相互作用 - 受体-配体结合 (Iannone et al. 2001) - 酶活性 - 蛋白-蛋白相互作用 - 抗体交叉反应与特异性 - 抗原表位扫描 临床诊断(Clinical Diagnostics) 分子诊断 - SNP (Colinas et al. 2000) - 疾病相关突变检测 - HLA分型 多重免疫诊断 - 血库(Smith et al. 1998). - 转染性疾病筛查 - 疫苗免疫效果筛查(Bellisario et al. 2001, Prevo