细菌小RNA的研究进展.docVIP

  细菌小 RNA 的研究进展# 徐庆春，李敏** （宁夏大学生命科学学院西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室，银川 750021） 5 10 15 20 25 摘要：细菌小 RNA 最早在大肠杆菌中发现 ，是近年来新发现的一类有别于真核生物小 RNA 的 RNA，它不编码蛋白，主要通过与细菌自身的 mRNA 结合或与蛋白质结合，参与细菌基因 的转录，翻译，mRNA 稳定，成熟和加工等多个过程来发挥调控作用。目前，对小 RNA 的研 究所采用的方法主要是先用生物信息学方法进行预测，然后再用分子生物学实验方法进行验 证并对其功能和机制进行研究。本文将详细阐述细菌 sRNA 的发现及相关的研究方法并对其 发展前景进行展望，以期揭示某些致病菌的潜伏存活机制，为人类的疾病治疗带来新的方法 和效果。 关键词：细菌；小 RNA；生物信息学方法；分子生物学实验方法 中图分类号：S963.21+1 The research progress of bacteria，s small RNA XU Qingchun, LI Min (key laboratory of ministry of education for protection and utilization of special of biological resources in west china, NingXia University, YinChuan 750021) Abstract: the small RNA in bacteria was first found in E. coli, which is a newly discovered RNA different from eukaryotes small RNA in recent years, it does not code protein, mainly play a role through the combination with its own mRNA or protain so that they can play a regulatory role in bacterials gene transcription, translation, mRNA stability, maturity and processing process and so on.At present, the research methods on small RNA is forecasting with bioinformatic approaches firstly, then using molecular biology experiment methods to testfy and researching its function and mechanic.This article will elaborate on the discovery of bacterial sRNA and related research methods and prospect its development prospects,looking forward to reveal the latent survival mechanism of certain pathogens in order to provide new method and effect of human diseases treatment . Keywords: bacterial; small RNA; bioinformatics methods; molecular biology experiment methods 30 长期以来，蛋白质被认为是控制细菌基因表达的唯一参与者，然而，随着分子生物学和 生物信息学的不断发展，近年来，发现了一类新的 RNA 在生物的生理调控中发挥巨大的作 [1]  RNA(noncodingRNA,ncRNA)，而在细菌中被称之为小 RNA(small RNA, sRNA)  [2-3]  ，sRNA 35 40 在细菌中具有广泛的作用，它参与细菌生命活动中生物学功能的调节（物质代谢、环境适应、 群体感应和细菌毒力），因此 sRNA 的发现及功能注释对了解细菌的致病机制至关重要。研 究细菌 sRNA 的作用机制及其对细菌毒力和致病机制的影响是当今科学界的一个热点问 题。目前，关于 sRNA 的研究甚多，一方面由于对 sRNA 的研究不断深入，以及大量细菌基 因组测序的完成，使得多种用于系统地发现和研究 sRNA 的方法被提出；另一方面由于 sRNA 碱基数目较少，同时 s