生物信息学数据库.pptVIP

于浩 生物信息学特指数据库类的工作，包括持久稳固的在一个稳定的地方提供对数据的支持 （Bioinformatics refers to database-like activities, involving persistent sets of data that are maintained in a consistent state over essentially indefinite periods of time）。 台湾 生物资讯学 是英文Bioinformatics的直接翻译.目前,各种生物数据库急速的发展,如何组织数据,并提取生物学新知识,需要以电脑(或计算机,computer)和网际网 (Internet)为重要凭藉, 迅速达成目标. 生物资讯学突飞猛进的发展,正在引发生物学研究的一场革命.这些发展必将影响到廿一世纪的农业,工业,医药和许多人类的活动. Entrze检索系统：NCBI SRS检索系统：EMBL、DDBJ SRS(Sequence Retrieval System)是由欧洲生物信息研究所(EBI)开发的以WWW界面运行的数据库检索及导航系统, 是目前生物信息界应用最为广泛的数据库系统。 SwissProt数据库中的所有序列条目都经过有经验的分子生物学家和蛋白质化学家通过计算机工具并查阅有关文献资料仔细核实。SIB和 EBI共有70多人的研究队伍，专门从事蛋白质序列数据的搜集、整理、分析、注释、发布，力图提供高质量的蛋白质序列和注释信息。 整合 Uniprot 特点 高质量 更新速度快 与其他数据库联系密切 使用快捷方便 分析工具齐全 Genome Browsers Ensembl Genome browser NCBI Map Viewer /mapview/ UCSC Genome Browser NCBI Map Viewer UCSC Genome Browser Ensembl Genome Browser Species in Ensembl 寻找染色体的某一区域 使用BioMart 知识点总结 核酸数据库：Genbank、DDBJ、EMBL 蛋白质数据库：Uniprot（swissprot、pir、trEMBL） 结构数据库：PDB、MMDB 基因组数据库：ensemble 序列的通用格式：fasta 结构的主要格式：pdb DDBJ与Genbank使用共同数据格式 DDBJ与EMBL使用共同的文本检索系统SRS NCBI所采用的文本检索： EBI-EMBL 意大利Monterotondo的欧洲分子生物实验室（EMBL）鼠生物学单元和西班牙赛维利亚大学 Pablo de Olaide的研究人员首次对活体老鼠的记忆分子机制进行了研究。发表于《学习和记忆》杂志最新一期上的该项研究发现，参与学习关键环节的分子通过TrkB和PLCg激活的信号路径影响记忆。 EMBL是世界上一流的研究机构之一，是欧洲分子生物的旗舰，在ISI 1992－2002年科学指示器对美国以外的研究机构的绩效研究结果中排名第一。目前服务于EMBL的人员超过1400人，来自60个国家。超过3000位研究人员组成了遍及欧洲甚至全世界的联系网。EMBL是世界闻名的高级培训中心，自1997年开始就有权颁布博士学位证书。 开展分子生物的基础研究 为会员国的研究人员提供优质服务 为会员、学生和来宾提供高级培训 为生物研究和技术转移开发新的仪器 另外，EMBL还举办各种重要的社会科学活动，并且为科学教师提供培训。 在过去的30年中，EMBL在以上方面对欧洲产生了深远的影响。之所以能取得这么好的成绩是因为EMBL是一个真正的国际/欧洲机构，因为她通过一流的生物研究取得重要成果并应用于大量的服务和设施建设，因为她将各层次的教育当作一种生活方式来看待。 位于海德堡（heidelberg）的欧洲分子生物学实验室 总部及所有工作人员 EMBL为了让高中老师能够更好的生物学训练，中心正在修建一座现代化的培训中心。 有关长期的分子生物学国际合作研究历史，着重于结构生物学研究，如光学测量系统、晶体学、X-线吸收光谱及小角散射 欧洲生物信息学研究所是一个非盈利学术机构，是欧洲分子生物学实验室的一部分。 它是生物信息学研究和服务的中心。它所管理生物数据的数据库包括核酸，蛋白质序列和大分子结构。 它的使命是保证从分子生物学和基因组研究的日益增长的信息向公众公开，并且对科学研究团体提供任何方面的免费使用，以促进科学发展 EMBL-EBI in Hinxton, UK休斯顿 与世界上其他分子生物学数据库进行合作研究，最主要的有EMBL核酸序列数据库，于1980年开始建立，随后参予了与日内瓦大学共同进行的SWISS