“中药标本馆数字化建设的探索与实践”研究工作报告.docVIP

全国卫生职业教育发展基金 课题编号： 09-ZC26 中药标本馆数字化建设的探索与实践 课题负责人所在单位 山东中医药高等专科学校 课 题 负 责 人 张 钦 德 二O一O年十二月  全国卫生职业教育研究发展基金2008~2009年度教育教学研究课题 课题名称 中药标本馆数字化建设的探索与实践 项目编号 09-ZC26 负 责 人 张钦德 所在单位 山东中医药高等专科学校 邮政编码 265200 通讯地址 山东省莱阳市文化路6号 传真号码 0535-7217062 填报日期 2010.12.28 中药标本馆数字化建设的探索与实践 研究工作报告 一、研究目的 （一）课题来源 本课题是编号09-ZC26。自年月批准立项以来，高职高专相关医学类专业教指委课题组成员，。研究全世界现已认知生物物种约100万种，凭证标本达3亿份（件）；我国植物物种占世界已知物种总数的10%左右，约10万种，凭证标本达3万份（件）。现今生物信息量爆炸性增长与从中获取新知识相对贫乏的矛盾越发突出，正成为全世界面临的重大问题，生物标本的数字化已成为国际学科领域最新趋势。 1. 国外研究概况西方国家早在70年代就开始了建立植物标本大型数据库的尝试。美国国家标本馆花费巨资，年把近20万份植物标本录入数据库，但使用Dbase II系统，在继续扩充中遇到数据不兼容和其他一些困难。美国堪萨斯自然历史博物馆开发的“物种分析者”（Species analyst）软件，可在几秒钟内生成世界地图，标明动物和植物的发现地、分布区和采集信息等资料美国圣迭哥超级计算机中心研制的应用，可将标本、生物、环境与气象等信息整合，为追踪气候变化的生态效应、保护濒危物种、管理有害物种入侵等提供依据。美国密苏里植物园20余年研制了数据库TROPICOS系统，但与其他系统不兼容且使用维护复杂，。美国哈佛大学等10余家标本馆进行了植物模式标本采集、物种信息管理和交换系统，并把已整合的信息网管理，但规模和信息量。 澳大利亚、南非和其他国家的一些标本馆初步完成了各自的物种和标本信息管理系统，但这些系统多互不兼容，而且难于适应标本量超过100万份以上的大型生物标本馆使用。澳大利亚科学家基于D/S/O平台开发的分类描述系统 (DELTA) 的代码已作为国际标准使用，其中也含有部分物种信息管理的内容，但这一系统同样不具备大规模采集和管理植物信息的能力。其他一些国家也提出了专家系统、神经网络、种类鉴定中的计算机视觉识别等创新性的研究思想。 高科技、高水准国际生物标本馆数字化程但形成统一的数据采集、管理、整合与交流体制；生物学家计算机专家设计思想不统一，使系统设计的预测性、兼容性和性低；软、硬件条件不合理。世界一些著名的大型标本馆在数字化进程中，多采用较为保守的态度，如英国邱园植物标本馆，目前仅在学名、地理分布等工具库中做一些工作，而大规模物种、标本和活植物信息的采集、录入、整合以及与其他国家的信息交流，尚处于观望和调研阶段。生物标本馆数字化2. 国内研究现状和发展趋势我国生物科学工作者在80年代初期，敏锐地捕捉到国际生物标本馆和植物园研究领域的数字化趋势。江苏植物研究所在80年代中期开展了以IBM计算机和电子表格lotus123建立模式标本数据库以及植物园信息管理系统，因界面差、操作不便和容量有限而搁置；中山大学植物标本馆在国家自然科学基金会资助下，与美国阿拉巴马大学合作研究“标本馆双语数据库”，但其基于的Dos平台和Dbase IV系统受到了自身发展的限制；台湾大学植物标本馆基于Dbase 平台设计了Pbase 标本信息管理系统（Tais），现已发展到用视窗界面Pbasew 系统管理台湾大学标本馆的20万份标本，并对地理信息有较好的表达；但因该馆标本量较小，系统的兼容性不强，尚未引起外界的广泛注意。 中国科学院的生物标本馆自80年代初期开展了生物标本馆的数字化研究，硬件的使用经历了早期苹果机、8086、286、386、486、586、奔腾II、Sunworkstation阶段；软件的开发和使用亦经历了电子数据表格、DBASE II、DBASE III、DBASE IV、Foxbase、Foxprow、Access、Oracle等阶段。现在中国科学院内已初步建成了生物物种和标本信息系统，完成了中国全部高等植物和部分动物物种信息的采集、录入和整合工作，也完成了中国科学院内各生物标本馆近50万