同步辐射在生物大分子结构研究中的应用-现代仪器.pdfVIP

二 ○○四年·第六期 综述与专论 同步辐射在生物大分子结构研究中的应用 1 2 杨瑞瑛 　　刘 　鹏 ( 1. 中国科学院高能物理研究所核分析技术开放实验室 　北京 　100039) (2. 中国科学院高能物理研究所同步辐射国家实验室 　北京 　100039) 摘 　要 　本文介绍同步辐射 X 射线衍射技术的特点及其在生物大分子结构研究中的应用。 关键词 　同步辐射X 射线衍射 　蛋白质结构 X 射线单晶衍射技术是最主要、最有效的方法。又 引言 由于同步辐射X 光源比常规 X 射线源有许多优点 , 世界上每一个生物体度是由细胞组成的 ,人体 所以用同步辐射光源测定生物大分子的结构更有无 就有成千上万的细胞 ,这些细胞不是简单的堆积 ,它 2 比的优越性 。 们彼此之间存在着信息的交流 ,而成为复杂的有机 同步辐射X 射线单晶衍射技术的特点 : 整体 ,相互配合 ,完成一系列生物功能。了解生命现 ( 1) 同步辐射产生高强度的 X 射线 ,使在晶体 象本质的最根本、最基础的前提 ,就是三维水平上研 因受到 X 射线辐射损伤之前的短时间内 ,就能收集 究蛋白质、核酸、脂质等生物大分子的空间静态及动 到所需的实验数据 ,也就是说用同步辐射光源可以 态结构 ,并在此基础上搞清空间结构和生物功能之 大大缩短摄谱所需时间。Hajdu3 等用实验室 X 光 间的关系。20 世纪末我国参加了生物基因组国际 源 ,为收集到糖原磷酸化酶 b 2 7A分辨率的衍射数 合作研究项目 ,随着大量模式生物基因组计划的完 ( ) 据 约 10000 个 ,总曝光时间约一周的时间 ,而以后 成 ,海量级增长的基因序列数据对生命科学将产生 用同步辐射 X 射线 , 只花了 25min 就收集到全部衍 不可估量的影响。由于基因的功能最终总是要通过 射数据。对于蛋白质晶体 ,X 射线损伤的限速过程 其表达产物 ———蛋白质来实现的 , 因此要了解基因 是照射产生的 OH 自由基的扩散,常温下该扩散的 的全部功能活动 ,必须回到蛋白质上来 ,蛋白质千变 时间尺度为数小时。因而 ,用同步辐射 X 射线测量 万化的功能都取决于其特定的立体结构。通过测定 时 ,在此时间范围内即可收集到全部数据 ,而且晶体 蛋白质分子三维立体结构可以精确确定蛋白质分子 不至于造成损伤。 中每一个原子的空间位置 , 以及蛋白质分子在发挥 (2) 利用同步辐射波长可任意改变的特性 ,可以 其功能时原子水平结构的变化 ,从而阐明蛋白质发 利用多波长反常散射技术 ,直接确定常规 X 射线晶 挥生物学功能的机理。这对于了解蛋白质与疾病的 体结构分析中最困难的相位参数。特别是用硒代替 关系 ,开展基于蛋白质三维结构的分子和药物设计 甲硫氨酸中的硫, 以及应用溴化脲嘧啶等标记,可方 具有重要意义。 便地分别用于蛋白质和核酸结构中相位参数的测 目前,测定生物大分子原子水平上立体结构最 定。1