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维普资讯 第27卷第3期 孙伟等：有机小分子与DNA的相互作用及其在DNA分析中的应用 47 化学试剂，2005，27(3)，149～152 有机小分子与 DNA的相互作用及其在 DNA分析 中的应用 孙伟 1,2，李清军 ，焦奎 ，陆路德 (1．青岛科技大学 化学与分子工程学院，山东 青岛 266042；2．南京理工大学 化工学院，江苏 南京 210094) 摘要：以有机小分子与 DNA的作用机理为基础 ，从分光光度法 、荧光法 、光散射技术 、电化学分析方法等多种分析手段 出 发，详细阐述 了有机试剂在 DNA分析 中的最新应用进展，并对今后的发展趋势进行了展望。 关键词：DNA；有机小分子；生物探针；相互作用 中图分类号：0657．1 文献标识码 ：A 文章编号 ：0258—3283(2005)03—0149—40 脱氧核糖核酸(DNA)是生物体 内的重要组成 共价结合是指有机小分子与 DNA的各种碱 物质，是遗传信息的主要载体 ，与生物的生长 、发 基以共价键结合生成稳定的配合物 ，主要有核酸 育、繁殖等正常生命活动及突变、癌变等异常生命 的烷基化反应 ，DNA的链 内交联 、链间交联反应 活动有关，因此 ，研究 DNA的结构和功能 ，可 以从 等，虽然符合条件的有机小分子不多，但与非共价 分子水平上了解生命现象的本质 ，解释药物的作 结合相比，其特异性识别能力要强得多 ，而且反应 用机理。许多有机小分子能与 DNA发生相互作 不可逆 。 用，通过各种模式的作用机理影响到基因的调控 1．2 剪切作用 和表达，因此研究有机小分子与DNA的相互作用 有机小分子通过与 DNA分子双链的特异性 很有实际意义，一方面可作为生物探针建立测定 结合而导致 DNA链的断裂，这种剪切作用导致 DNA高灵敏的分析方法 ，另一方面可 以作为靶 向 DNA的损伤，也是导致基因突变的原因。 分子研究其与 DNA作用的模式和机理及生物活 1．3 长距组装 性之间的关系。 带正电的有机小分子对 DNA有凝聚作用，当 其与 DNA作用时 ，会诱导 DNA超螺旋结构的形 I 有机小分子与 DNA相互作用机理 成。有机小分子在 DNA表面进行排列或堆积称 DNA的基本结构单元是脱氧核苷酸，它是 由 为有机小分子在DNA分子表面的长距组装 。 磷酸、D．2．脱氧核糖和碱基 (腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧 1．4 非共价作用 啶、胸腺嘧啶)组成 。DNA的一级结构是 由核苷 1．4．1 静 电作用 酸通过 3，5-磷酸二酯键连接而成 的没有支链 的 指小分子与 DNA分子的带负电荷的核糖磷 直线形或环形结构 ，二级结构是 由2条多脱氧核 酸基骨架之间通过静电作用而结合 。该作用没有 糖核酸链组成的双螺旋状结构 ，其 中磷酸和糖链 选择性 ，是非特异性的。 在螺旋外侧 ，碱基在螺旋 内侧 ，以氢键相结合在一 1．4．2 嵌入结合 起呈互补结构 ，在二级结构的基础上，可进一步扭 指小分子嵌入 DNA分子双螺旋的碱基对之 曲形成超螺旋的三级结构。 间的大沟槽与 DNA相互作用而结合，结合的作用 DNA分子中平行堆积的碱基 、聚合的阴离子 力来 自芳环的离域 丌体系与碱基的7t体系 问形 磷酸骨架和两条核苷酸链螺旋形成的大沟和小沟 成玎一7t相互作用及疏水相互作用。大部分金属 构成了有机