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利用Gaussian 计算乙烷分子的能量
乙烷分子由于C-C 单键的可旋转性,两个甲基呈不同的夹角时,分子的能量也不同。
# hf
C2H6
0, 1
C
H 1 1.1
H 1 1.1 2 109.28
H 1 1.1 2 109.28 3 120.0
C 1 1.2 2 109.28 3 -120.0
H 5 1.1 1 109.28 2 (A )
H 5 1.1 1 109.28 6 120.0
H 5 1.1 1 109.28 6 -120.0
其中,(A )的值分别取10、20、30、40 、50、60,得到各角度时的能量如下:
角度 (degree ) 能量(Hartree)
0 -78.13439
10 -78.13586
20 -78.13985
30 -78.14522
40 -78.15049
50 -78.15429
将能量对角度作图,得到:
该图像角度变化为半个周期。可以看出,夹角为60°时,即交叉型乙烷的能量最低;角度
为0°时,即重叠型乙烷的能量最高。
利用Gaussian 计算氢键的能量
1、醋酸分子的结构优化和能量
使用G98View 建立CH COOH 分子模型后,使用G98w 对CH COOH 分子结构进行优化,当选
3 3
择基组为rb3lyp/6-31+g(d,p)时,得到最终结构为:
C
H,1,B1
H,1,B2,2,A1
H,1,B3,2,A2,3,D1,0
C,1,B4,2,A3,3,D2,0
O,5,B5,1,A4,2,D3,0
O,5,B6,1,A5,2,D4,0
H,7,B7,5,A6,1,D5,0
Variables:
B1=1
B2=1
B3=1
B4=1
B5=1
B6=1.359521
B7=0
A1=110.08052
A2=107
A3=109
A4=126
A5=111
A6=107
D1=-119.8275042
D2=120
D3=-121
D4=58
D5=179
使用ab initio 方法中的Hartree-Fock 方法,得到分子的能量为HF=-229.1058285au 。
2、醋酸+水体系的优化和能量
使用G98View 建立CH COOH 分子和H O 分子相互作用的模型,再使用rb3lyp/6-31+g(d,p)基
3 2
组对体系进行优化,得到结果如下:
C
H,1,B1
H,1,B2,2,A1
H,1,B3,2,A2,3,D1,0
C,1,B4,2,A3,4,D2,0
O,5,B5,1,A4,2,D3,0
O,5,B6,1,A5,2,D4,0
H,7,B7,5,A6,1,D5,0
O,7,B8,5,A7,1,D6,0
H,9,B9,7,A8,5,D7,0
H,9,B10,7,A9,5,D8,0
Variables:
B1=1.094366
B2=1.089445
B3=1.094286
B4=1.505586
B5=1.225473
B6=1.339793
B7=0.99126
B8=2.72447
B9=0.978016
B10=0.9647
A1=110.067252
A2=107.292657
A3=109.659586
A4=124.171217
A5=112.622873
A6=108.758755
A7=93.614739
A8=78.041106
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