中药活性成分对血栓素A2受体抑制作用的分子模拟.pdfVIP

物理化学学报(WuliHuaxueXuebao) September ActaPhys．一Chim．Sin．，2010，26(9)：2549—2556 2549 (Article] www．whxb． pku．edu．ca 中药活性成分对血栓素A2受体抑制作用的分子模拟 刘海波 崔 巍 徐 峻 ， 彭 勇 ， 周家驹 肖培根 (中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所，北京 100193；。中国科学院研究生院化学与化学工程学院， 北京 100049； 。中山大学药学院，广州 510275 中国科学院过程工程研究所，北京 100190) 摘要： 中药中黄酮类化合物和白藜芦醇等活性成分对血栓素A2受体具有抑制作用，但具体机理不详．本研究 通过同源模建方法，以墨鱼视紫红质蛋白为模板，构建血栓素A2受体的蛋 白质结构模型．并使用分子对接方法 研究中药活性成分白藜芦醇和芹菜苷元与血栓素 A2受体模型的作用方式，据此建立药效团模型，筛选其他潜 在的血栓素A2受体抑制剂．结果表明：白藜芦醇等中药活性成分能与血栓素A2受体活性口袋中的残基发生氢 键作用，结合方式与血栓素相似．血栓素与 Ser201、Leu198、Arg295和Thr298发生氢键作用，白藜芦醇等活性成 分与Ser201、Leu198和Arg295发生氢键作用．建立的药效团模型由7个药效元素以及排斥性空间元素组成，经 测试对高活性的血栓素A2受体抑制剂有 比较好的选择性．使用该药效团模型对中药天然产物数据库进行筛选， 命中了一批可能具有血栓素A2受体抑制作用的活性化合物．其中一些已经报道有抑制血小板凝聚活性．本研 究表明血栓素A2受体可能是活血化瘀类中药的一个潜在的靶点． 关键词： 中药；药物靶标；血栓素受体；活血 中图分类号： O641 M olecularSimulationsoftheInhibitionofActiveComponentsin TraditionalChineseM edicineontheThromboxaneA2Receptor LIU Hai—Bo CUIW ei XU Jun。 PENG Yong’ ZHOUJia—Ju XIAO Pei—Gen (InstituteofMedicinalPlantDevelopment,PekingUnionMedicalCollege，ChineseAcademy MedicalSciences, Bejiing 100193，P．R．China； CollegeofChemistryandChemicalEngineering，GraduateUniversityofChinese AcademyofSciences,Beijing 100049，P．R．China；3SchoolofPharmaceuticalSciences，SunYat—senUniversiyt，Guangzhou 510275，P．R．China；41nstituteofProcessEngineering，ChineseAcademyofSciences,Beijing 100190,P．R．China) Abstract： SomenaturalproductsfromtraditionalChinesemedicine (TCM)suchasflavonesandresveratrolhave beenreportedtohavethromboxaneA2receptorfrp)inhibitingactivity．Ⅵ investigatedapossibleinhibitionmechanismbya homologymodelofTP，whichwasb