k-ras基因寡核苷酸芯片的研制及在胰腺癌组织中检测应用研究.pdfVIP

维普资讯 · 144 · 临床消化病杂志2007年第 l9卷第3期 k．ras基 因寡核苷酸芯片的研制及在胰腺癌组织 中检测应用研究 郭树斌 。杨 红 ，陆星华 ，钱家鸣 ，伍东升 (1、中国医学科学院 中国协和医科大学 北京协和医院急诊内科，北京 100730 2、中国医学科学院 中国协和医科大学 北京协和医院消化 内科) 摘 要： 目的 建立ras基因寡核苷酸芯片对胰腺癌基因突变的检测系统。评估 16例胰腺癌组织k-ras基因l2、l3、6l位密码子 变突检测。方法 采用双重或单独不对称PCR扩增标本中的目的DNA。扩增产物加杂交液后与芯片进行杂交、清洗、扫描。结果 l6 例胰腺癌组织中k-ras为75％，突变都发生在 12密码子，k-ras以I2密码子第2位核苷酸突变发生率高(8／12)。结论 k-ras基因芯片 系统具有高度的灵敏性和准确性、快速简便、自动化程度高等优点，可同时检测胰腺癌 k-ms多个突变位点基因，有利于临床应用。 关键词： 胰腺癌 ； k—ra8； 寡核苷酸芯片 [中图分类号]Q349，R735．9 [文献标志码]A [文章编号]1005-541X(2007)03·144·03 。 EstablishmentandApplication ofk-rasOligonucleoideM icroarray in PancreaticCancerTissue GUO Shu-bin’YANG Hong2 LU Xjng-huaz QIANJia-minL~2，WUDong·sheng2 ， ， ， 1．DepartmentofEmergency。PeldngUnionMed／calCollegeHospital，PekingUnionMedicalCollege，ChineseAcademyofMedicalSci- 蛐懈 ，Beiiing100730，China 2．DepartmentofGastroenterology，PekingUnionMedicalCollegeHospital，PekingUnionMedicalCollege，ChineseAcademyofM edical Sciences，Beijing100730，China Abstract：Obje~ive Establisholigonueleotidemieroarraysystemtodetectk-rasmutationin16pancreaticcnacerspecimens．Methods DNA WSSamplifiedbydoubleorsingleunsymmetricalPCR ．PCR productswith chipswere hybridized，washedandscna ned．Results Inallhte specimens，12Wasdetectde withk—rasmuattions(75％)．Themostfrequentmuattionsitesink—raswerethesecondbaseofcodon12(8／12)in pnacreaticcnacertissue．Condusion k-rasoncogeneoligonueleotidechipsprovidarapid，Scnstivenadhighly—automatde waytodetectmuattions indifferentsites ．Itisusefulfortheclinicapplicationinhtefuture． Keywords： Pnacreaticcna c