表皮生长因子受体在肿瘤发生中作用及机制.pdfVIP

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2017-09-13 发布于重庆
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表皮生长因子受体在肿瘤发生中的作用及机制柏庆然，丁淼，丁晓，郭文婷，李亚朴，张新新表皮生长因子受体（epidermal growth factor receptor, EGFR ） 1986 Physiology or Medicine 预测跨膜结构（疏水结构）进入ExPASy的网站： /tools/protscale.html，选择 Hphob. / Kyte Doolittle 。将氨基酸序列输入预测跨膜结构 • 使用TMHMM 网站可预测蛋白的胞内区域和胞外区域： • # sp_P00533_EGFR_HUMAN Length: 1210# sp_P00533_EGFR_HUMAN Number of predicted TMHs: 2# sp_P00533_EGFR_HUMAN Exp number of AAs in TMHs: 42.29864# sp_P00533_EGFR_HUMAN Exp number, first 60 AAs: 0.88712# sp_P00533_EGFR_HUMAN Total prob of N-in: 0.04662sp_P00533_EGFR_HUMAN TMHMM2.0 outside 1 645sp_P00533_EGFR_HUMAN TMHMM2.0 TMhelix 646 668sp_P00533_EGFR_HUMAN TMHMM2.0 inside 669 772sp_P00533_EGFR_HUMAN TMHMM2.0 TMhelix 773 795sp_P00533_EGFR_HUMAN TMHMM2.0 outside 796 1210 预测重复结构 • 无重复结构 • COSMIC网站 • Catalogue of Somatic Mutations in Cancer - COSMIC • www.sanger.ac.uk/genetics/CGP/cosmic • 找出EGFR在癌细胞里的突变位点，分析这些突变为什么会引起癌症。 • 分别由三个位点在癌症中突变频率较高 • 858 L-R、 • 790 T-M • 719 G-SCA EFGR 6个物种比较保守 6个物种比较保守序列进化 Erbb 蛋白家族保守结构域重复序列比对比较保守与其他激酶家族结构域比对保守区域