不同位点碱基替代对标定鸭科分子钟的影响.pdfVIP

中国畜牧兽医 2012年第39卷第7明 生物技术 ·53· 不同位点碱基替代对标定鸭科分子钟的影响 盂冬梅 (菏泽学院制药工程系，山东菏泽 274015) 摘要：试验使用GenBa吐中已知的鸟类绍施色素b(Cytb)基因部分序列(1044bp)共13条序列，其中鸡形目4条、鸭科 鸟类9条】作为本研究的数据集，并以鸡形目与雁形目(鸡／绿头鸭)的分歧时问(89．8MYA)为锚定点，用核苷酸不同替代模 型对鸭科的分子钟进行标定。雉科与鸭科间的分歧时间的估计值为116．3785 时间为63．8823 MYA(“1+2TiTv”)，鸡与鹌鹑的分歧时间为37．6708 间的估计值为1．879331 雉科与鸭科、雁属与鸭属两个接近基部类群的分歧时问发生在白垩纪(137—65MYA)，支持鸟类早期历史发生在自垩纪的 观点。 关鐾词：分子钟；细胞色素b(Cytb)；鸭科；分歧时阊 中围分类号：Q75 文献标识码：A 文章编号：1671．7236(2012)07—0053—05 Zuekerkandl等(1965)提出分子钟(molecular等，2006)。与氨基酸序列相比，DNA序列不仅包括 clock)假说，为人类学家、生物学家和古生物学家的多种序列区域且密码子不同位点碱基替代模型比较 工作提供了一套丰富而独立的结果(Mark，1999)。复杂，用来描述核苷酸替代的模型有许多种(Posada 分子钟为探究早期生命演化提供了一个薪的途径 (Bromham等，2003)，对研究生物进化具有一定意 义，且对于一些起源年代不清楚，缺少化石或地质记 录不伞的牛物类群的进化研究作用很大(Prasad，1990)。从核苷酸序列的变化来研究物种间的进化 2009)。分子钟假说为追溯物种起源事件和类群的和物种间的亲缘关系较其他方法更为精确可靠(姜 分歧时间提供了理论基础，为培育具有各种优良特 海英等，2000)。本研究选择线粒体细胞色素b(Cyt 性的农副产品新品种、保护物种多样性和种质的遗 b)基因及其核苷酸序列6种不同的替代模型分析鸭 科中部分类群的起源及其基部类群的分歧时间，旨 传特性提供保障(李昂等，2010；王福生等，2010)。 分子钟在进化生物学领域成为一种重要工具，已经 在研究探索一种有效丽合理的模型，为分子钟的应 在各种基因上应用分子钟来追溯从艾滋病到鸟类和 用提供新的方法。 l材料与方法 鲸类等物种的进化轨道(Doolittle等，1996)，在系统 学、生态学和保护遗传学方面发挥了举足轻重的作 1．1材料来源13条鸟类线粒体细胞色素b基因 序列来自GenBank(表1)。 用(Bromham等，2003；Yoder等，2000；Thorpe等， 2005)。大多数现代分子生物学家常常也据此进行 表l用于分子钟标定的数据集 分子进化机制的研究，并推算现有一些重要生物的 品种名称 GenBank登录号 起源时问(Prasad，2009；Doolittle等，1996；邱会平 原鸡属(Gallusgallus) 鹌鹑眉1(Coturnixjaponica1) 等，2010,毛康珊，2010#李春香等，2010；Hao等， 2) 孙∞n 鹌鹑属2(Coturnixjaponica 2010；赵亮等