不同物种肌细胞生成素基因序列结构与功能特性的生物信息学分析.pdfVIP

No．7 64· Animal Medicine2012V01．44 HusbandryVeterinary 不同物种肌细胞生成素基因序列结构与 功能特性的生物信息学分析 宋兴超，魏海军4，杨镒峰，陈秀敏，薛海龙，岳志刚 (中国农业科学院特产研究所，农业部特种经济动物遗传育种与繁殖重点实验室， 特种经济动物分子生物学国家重点实验室，吉林长春130112) 兔和家鸡myoG基因完整编码区核苷酸及其氨基酸序列的分子结构、理化特性、糖基化位点、信号肽、跨膜区、二级结构、高级结构域以及基于 该基因编码氨基酸序列的5个物种之间的进化关系进行了系统的生物信息学分析。结果表明：猪、牛、绵羊、家兔和家鸡myoG基因核苷酸序列 组成结构特点及其编码蛋白质的理化特性基本一致，均属于疏水性不稳定蛋白质；猪、牛和绵羊均含有6个潜在的N-糖基化位点，丽家兔和家鸡 基础。 关键词：肌细胞生成素基因；结构；功能；生物信息学；畜禽 中图分类号：Q754 文献标识码：A 文章编号：0529—5130(2012)07—0064—05 高生长速度、瘦肉沉积率及优良肉质性状一直是 一个优秀候选基因。8J，最终可能会导致畜禽产肉量 肉用动物长期以来的育种目标，畜禽的产肉能力及肌 与肉质的变异。 肉品质均与肌纤维的数量和类型密切相关…。在胚 鉴于myoG基因在骨骼肌肌纤维生长发育及调控 胎形成过程中，动物肌纤维的生长发育已经完成，已 畜禽肉质性状方面的重要作用，国内外科研人员对其 3。、 有研究表明，肌纤维的生成受生肌调节因子家族 进行了大量的研究。迄今为止，许多SL动物∽。1 (myogenicregulatoryfactors，MRFs)在分子水平上的 调控，该家族包括MyoDl、肌细胞生成素(myoge— 4个肌肉特异性转录因 特性的系统研究却鲜见报道。为此，本研究选用 nin，MyoG)、Myf-5和Myf一6 helix— 子，它们的表达产物具有螺旋一环一螺旋(basic GenBank中猪(Susscrofa)、牛(Bostaurus)、绵羊 (Ovis loop．helix，bH．L—H)结构，代表控制骨骼肌生成很多aries)、家兔(Oryctolagus 方面的关键调节因子悼J。Hasty等o和Nabeshima(Callus 等。4o研究发现，在胚胎时期，单独敲除myoG基因组学与生物信息学相结合的方法分析了不同物种该基 后，小鼠出生后会由于严重的骨骼肌发育缺陷而死 因编码区核苷酸及相应氨基酸序列的结构特征与理化 亡，而单独敲除其他3个基因却可以出现正常、成熟 特性，并进一步基于氨基酸序列构建了5个物种的系 统进化树，旨在为深入开展myoG基因分子结构、表 的骨骼肌。由此可见，MyoG是MRFs家族中最重要 的一员，在肌细胞分化过程中起中心调节作用，调控 达调控、生物学功能分析及其在畜禽骨骼肌生长发育 中胚层细胞分化为成肌细胞，促进成肌细胞增殖，使 分化过程中的分子遗传机制与动物的分子育种工作提 单核成肌细胞转变为多核的肌纤维。进一步研究表 供生物信息学理论依据。 明，该基因的遗传变异与畜禽肌纤维数量及其生长速 1材料与方法 度相关，是影响肌纤维特性、胴体品质及生长性状的 1．1序列来源 收稿日期：2011-06-21 基金项目：农业科技成果转化资金项目一梅花鹿优质高效繁育