镉胁迫下萝卜基因组DNA甲基化敏感扩增多态性分析.pdfVIP

镉胁迫下萝卜基因组DNA甲基化敏感扩增多态性分析.pdf

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维普资讯 植物生理与分子生物学学报,JournalofPlantPhysiologyandMolecualrBiology2007,33(3):219—226 219 镉胁迫下萝 l、基因组DNA 甲基化敏感扩增多态性分析 杨金兰-,柳李旺-,龚义勤。,黄丹琼。,王峰。,何玲莉。 ·南京农业大学园艺学院,作物遗传与种质创新 国家重点实验室 南京 210095: 北达科他州立大学植物科学系,法戈,ND58105,USA 摘要:应用甲基化敏感扩增多态-I~(MSAP)技术分析了重 等 2004;Aina等 2004)。 金属镉 (cd)胁迫处理后萝 卜基因组DNA 甲基化程度的变 DNA甲基化调节植物基因的表达 ,从而影响生 化。结果表明,经50、250和500mg/LCdC1,处理后,MSAP 长发育的调控(Gonzalgo和 Jones1997)。植物 DNA 比率分别为 37%、43%和51%,均高于对照(34%);全 甲 甲基化是一种普遍现象,但DNA甲基化水平因植物 基化率(双链CCGG)分别为23%、25%和27%,而其对 种类而异,大约 30%的核基因组DNA胞嘧啶处于 照为22%,表明重金属CdC1胁迫后,某些位点发生了重 新甲基化。萝 卜叶片DNA中总甲基化水平的增加与CdC12 甲基化状态 (Richards1997)。DNA中被 甲基化的碱 处理浓度呈显著正相关。甲基化变异可分为重新 甲基化、 基一般是 C (胞嘧啶),主要是 5.甲基胞嘧啶(5mC) 去甲基化、不定类型以及与对照相同的甲基化模式等类 在 CPG或 CPNPG (N 为任意碱基)中形成 的 型,Cd胁迫处理引起的植株基因组DNA甲基化程度的提 (Gruenbaum等 1981)。 高主要是重新 甲基化。 甲基化敏感扩增多态性(methylation—sensitive 关键词:萝 卜;镉胁迫;DNA 甲基化;甲基化敏感扩增 amplificationpolymorphism,MSAP)是改 良的AFLP技 多态性 术,采用对基因组DNA 甲基化敏感性不同的2种限 中图分类号:Q74 制性内切酶HpalI和MspI代替AFLP分析中识别4碱 基的内切酶MseI,分别与识别6碱基的EcoRI配对 , 随着城市化进程加速和工业生产的发展,越来 对5-CpCpGpG位点甲基化进行特异性扩增;这2种 越多的污染物进入环境,尤其是重金属离子,能长 酶都能识别并切割 CCGG序列,但对该位点胞嘧啶 期存 留于土壤和水体中,通过富集作用大量积累于 甲基化 的反应不同。HpalI对 CCGG中的任一个胞 植物体(包括其可食部分),因而通过食物链进入人 嘧啶 甲基化都敏感 ,不能消化含 CCGG、C CGG 体危及健康。镉(Cd)是环境中主要的重金属污染物 和mCmCGG的位点,但对半 甲基化(即只有一条DNA 之一 ,其毒性大 ,蓄积性强 。它不是植物生长发 链的外侧胞嘧啶发生 甲基化)序列仍有酶切活性;而 育所必需的元素,但易被植物吸收,植物体吸收和 MspI对外侧胞嘧啶 甲基化敏感,即仅不能消化含 富集后会阻滞植物的生长发育(Hart等 1998),通常 CCGG和mCCGG的位点,能切内甲基化(CCGG) 出现生长迟缓,植株矮小、褪绿、产量下降等症 序列,因而能够很好地反映基因组DN

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