橡胶树水通道蛋白基因HbPIP1；2和HbPIP2；2的克隆及序列分析.pdfVIP

西北林 学院学报 2Ol1，26(6)：56～61 JournalofNorthwestForestryUniversity 橡胶树水通道蛋白基 因HbPIP1；2和 H P 尸2；2的克隆 及序列分析 黄 娟 ，安 锋 ～，庄海燕 ，喻修道 ，张硕新 ¨ (1．西北农林科技大学 林学院，陕西 杨陵 712100；2．农业部 橡胶树生物学重点开放实验室 ，海南 儋州 571737 3．InstituteforTechnologyResearchandInnovation，DeakinUniversity，Geelong，Vic，3217，Australia； 4．陕西秦岭森林生态系统 国家野外科学观测研究站 ，陕西 宁陕 711600) 摘 要 ：根据 GenBank中已经公布的不同植物水通道蛋 白(AQPs)的保守氨基酸序列设计简并引物， 结合 RT-PCR和 RACE技术，从橡胶树 (Heveabrasiliensis)中克隆了2个 AQP基 因的全 长 cDNA序 列，并对其进行生物信息学分析。结果获得橡胶树 2个AQPs基 因的全长，分别命名为 HbPIP1；2和 H6P P2；2。H6PP1；2编码 273 氨基酸，理论分子量为 29．15kD，等 电点为 8．55；H6P，P2；2编码 278个氨基酸，理论分子量为29．78kD，等电点为8．2O。HbPIP1；2和 HbPIP2；2均具有 6个跨膜区 和 MIP家族信号序列 SGXHXNPAVT，为疏水性蛋 白；HbPIP1；2和 H6PIP2；2与同科蓖麻水通道 蛋 白基 因RcPIP1—3和 RcPIP2—1的同源性分别为 91 和 89 ，并具有相 同功能域。因此，推测 Hb- PJP1；2和 H6PJP2；2都属于水通道蛋 白基 因家族的新成员。 关键词 ：橡胶树 ；水通道蛋 白；PCR；RACE；序列分析 中图分类号 ：$794．104 文献标志码 ：A 文章编号 ：1O01-7461(2011)06—0056-06 M olecularCloningandSequenceAnalysisofHbPIP ；2andHbPIP2 2 AquaporinGenesinHeveabrasiliensis HUANG Juan一，AN Feng～，ZHUANG Hai—yan ，YU Xiu—dao。，ZHANG Shuo-xin (1．College0／Forestry，NorthwestAF University，Yangling，Shaanxi712100，China； 2．KeyLaboratory0，RubberBiologyofMinistryoJAgriculture，Danzhou，Hainan571737，China； 3．Institutel，rTechnologyResearchand [nnovation，DeakinUniversity，Geelong， (，3217，Australia； 4．QinglingNationalForestEcosystem ResearchStation，Ningshan，Shaanxi711600，China) Abstract：DegenerateprimersweredesignedbasedontheconservedaminoacidsequenceofthepublishedAQPs from differentplantspecies，themethodofRT-PCR andRACE wereadoptedandtwofull—lengthcDNAsencoding aquaporinswereclonedfrom thebarkofHeveabrasiliensis．Bioinformaticstoolswereappliedtoanalyzeboththe cDNA sequenceandproteinsequence．TwoAQPgeneswereobtainedf