2007年江西省甲3亚型流感毒株HA1基因特性的分析.pdfVIP

实验与检验医学 2008年 12月 第 26卷 第 6期 · 实验研究 · 2007年江西省 甲3亚型流感毒株HA1基因特性的分析 周 琚 邹明霞 熊 英 龚 甜 曾艳文 施 勇 中图分类号R373．13．Q343A*7 文献标识码A 文章编号 1674—1129(2008)06—0613—03 摘【要】目的 了解江西省2007年分离的甲3亚型流感病毒株HAl基因变异特征 ，分析WHO2007～ 2008年 甲3亚型疫苗推荐株对江西省 甲3亚型流感的预防效果 方法 采集监测医院和疑似流感疫情 的流感样病例鼻咽拭子标本进行流感病毒分离 ．对分离到的H3型流感病毒进行核酸提取 ．采用逆转录一 聚合酶链反应(RT—PCR1扩增病毒 HA1基 因后进行核苷酸序列测定 ，用 DNAStar5．0、BioEdit(Version5．o1、 Mage生物软件对测序结果进行分析处理 ．推导出氨基酸序列，进行基 因特性分析。 结果 所选取的8株 甲3亚型流感病毒 HA1区域核苷酸序列长度均为960bp，未发现核苷酸 的丢失和插入 ．平均点突变率为 1．13％ 2007年 甲3亚型流感病毒分离株与 2007～2008年 WHO疫苗推荐株 HA1区相 比较 ．不同毒株氨 基酸的同源性是 97．8％ 98．4％．在 2个抗原决定簇 区的氨基酸变异数平均为 3_25个 。但有毒株 已出现在 2个抗原决定簇区4个氨基酸替换 结论 2007年根据WHO2007～2008年推荐疫苗株生产的疫苗对我 省的甲3亚型流感预防效果不够理想 [关键词】 甲3亚型流感病毒；分离株；疫苗株；HA1区域；预防效果 流行性感冒简称流感 ．是 由甲、乙、丙三型流感 胞病变和微量血凝实验方法fHA1来判断是否有病毒 病毒分别引起的急性呼吸道传染病 而甲型流感病 存在 。将 HA≥1：8的标本采用血凝抑制方法(HI1进 毒常以流行形式出现 ．在上世纪曾引起 了三次流感 行流感病毒型别鉴定 f标准血清由国家流感 中心提 大流行 ．H3N2亚型流感病毒引起上世纪的第三次 供1。 流感大流行，并一直在世界流行。流感病毒血凝素 1．4病毒 RNA提取 抗原是流感的主要抗原之一 ．是流感发生抗原性变 选择不同时间、来 自不 同流感监测医院或不 同 异的分子基础 我国是世界上公认 的流感多发地甚 设区市f县区1的疑似流感爆发疫情送检标本分离的 至是发源地 ．其机理至今尚不清楚r1]。为了及时了解 甲3亚型流感病毒 ．取病毒新鲜细胞培养液 2001x1． 流感病毒的流行和变异情况 ．开展实验室监测是必 采用德国QIAGEN公司的RNeasyMiniKit提取．具 要的手段 江西省疾病预防控制 中心 自2004年开 体步骤参考产品说明书 始开展流感病原学监测 ．为了解江西省 甲3亚型流 1．5HA1基 因RT—PCR 引物2[1．均为上海生工公 感分离株的基因变异情况 ．我们对 2007年江西省部 司合成：RT—PCR方法嘲。 分甲3亚型流感病毒分离株 HA1基 因进行 了序列 1．6核苷酸序列测定 PCR产物送上海生工公司 测定和分析。现将结果报告如下。 测定 1材料与方法 1．7 序列分析 1．1标本来源 核苷酸和氨基酸采用 DNAStar5．0、BioEdit5．0、 采集 2007年流感监测医院和疑似流感爆发疫 Mage序列分析软件分析 。摘录在 GenBank中收录 情所采集的流感样病例的咽拭子标本 。 的2007—2008H3N2流感疫苗推荐株 (~awiscosin／ 1．2 狗 肾传代细胞 (MDCK)、流感标准毒株和抗血 67／20051的HA1区序列作为参 比进行分析