核rDNA ITS区序列在水产动物研究中的应用.pdfVIP

维普资讯 安徽农学通报 ，AnhuiAgn．Sei．Bul1．2007，13(11)：99—101 核 rDNAITS区序列在水产动物研究中的应用 王 庆 傅洪拓 ， (1南京农业大学无锡渔业学院，江苏无锡 214081； 2中国水产科学研究院淡水渔业研究中心，农业部水生生物遗传育种和养殖生物学重点开放实验室，江苏无锡 214081) 摘 要：在水产动物的研究中，作为对线粒体 DNA信息的重要补充，人们越来越多地采用核 DNA的核糖体内转录间 隔区(ITS)作为分子标记。本文介绍了ITS 的结构特征 ，概述了ITS在水产动物研究中的应用，并分析 了ITS应用于 水产动物时存在的问题及其应用前景。 关键词：基因间隔序列(ITS)；水产动物；遗传多样性；系统分类 中图分类号 $96 文献标识码 B 文章编号 1007—7731(2007)11—99—03 作为一种遗传标记技术，DNA序列测定直接从遗传 5．8S和28SrRNA之间的片段 ，称之为 ITS2(internaltran— 物质 DNA的核苷酸组成上检测遗传变异 ，因此 ，它是区分 scribedspacer2)即核糖体 RNA第二 内转录间隔区。。 个体问遗传差异最彻底的分析方法，能提供基因组特异区 ITS区包括 ITS1和 ITS2，有时将 ITS1，5．8SrRNA和 ITS2 域的完全的遗传信息。随着mtDNA序列的大量积累，人 统称为ITS 区，其结构如图所示 们越来越迫切地想得到变异更为丰富的核DNA的信息来 对mtDNA的资料进行补充，以便对所研究的对象有一个 更加全面准确的认识。在核 DNA中，核 rDNA内转录间 图 1 ITS区的组成 隔区(internaltranscribedspacer，ITS)受到人们 的普遍关 ITS1和 ITS2是rDNA的两个 内部转录问隔区(inter— 沣 ：1] naltranscribedspacer)，具有种 内变异小而种间变异大 的 1—L 0 在核DNA中，不同蛋 白质基因的编码序列，mtDNA序 特性，是种类鉴定和系统发育分析的重要分子标记 ，并 列和内转录间隔区(ITS)以及一些其他编码序列对于分析 已有大量的相关研究报道 。各个 RNA亚基间的 ITS 物种的系统发生和群体遗传学具有重要的意义。其中，内 序列 ，其长度和序列在不 同的种类 中有着非常大的差异， 转录问隔区(ITS)位于核糖体18S、5．8S、28SrRNA基因的 而且在同一个体的不同操纵子上的ITS序列也可能是不 编码区之间，它比编码 区序列进化速度快 ，因此在不同的 同的，在长度和序列上也有着差异，说 明在动物的进化过 物种中更适合作种问、亚种或种群水平上的系统发生以及 程 中它是具有很高的可变性 。 遗传多样性研究 “。 ITS 被成功的广泛应用于研究有两个主要原因：其一 ， 本文将对 ITS序列的结构特征和在水产动物研究中 ITS1和 ITS2分别位于 18S一5．8S和 5．8S一28S之间，从 的应用方向作一概述。 细菌、真菌到高等动、植物的 18S、5．8S、28S的序列都是高 1 ITS结构特征、优势和不足 度保守的，这样对于设计 PCR引物并且对于 PCR扩增非 目前 ，用于分析系统学研究的基因序列，主要有线粒 常有利；其二，ITS 序列的进化速度较快，而且在核基因组 体DNA和核糖体DNA。核糖体是一个致密的核糖核蛋白 中是高度重复、且不同ITS 拷贝问的