遗传重组微生物的环境监测.pdfVIP

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遗传重组微生物的环境监测 张霞1*, 陈中义 2 , 张杰 2 , 宋水山 1, 李国勋 3 (1.北省生物所,石家庄 050051 ;2. 中国农科院植保所植物病虫害生物学国家重点实验室, 北京 100094;3.莱阳农学院,青岛 266109) 摘要:遗传重组微生物(GMM)的环境监测作为生物安全性评价的重要内容之一,正越来 越得到广大科研工作者的密切关注。本文综述了目前遗传工程菌和重组 DNA 的环境监测 的 主要方法。一是基于培养的方法,包括利用选择性培养技术,报告基因,基因探针和 PCR, 免疫监测等 ;一是基于免培养的方法 , 包括显微镜观测法 ,荧光原位杂交技术(FISH),基于 直接提取微生物总 DNA 的分子生物学方法等。重点介绍了目前常用的几种报告基因和基于 直接提取总 DNA 的 DGGE/TGGE 方法,同时指出我国应加强 GMM 遗传监控的分子生物学 方法的研究及应用。 关键词:遗传重组微生物(GMM);生物安全;监测方法 遗传重组微生物(Genetically modified microorganism, GMM)的环境监控主要包括:一 是监测遗传工程菌在环境中的生存,种群建立,在植物根系定殖能力以及重组 DNA 在土壤 土著微生物中的转移;二是监测遗传工程菌释放后对环境的潜在冲击,主要指环境微生物群 体结构(分类)的变化和代谢类型的变化[1] 。利用遗传工程菌本身所带有的许多特性例如抗 性、生物发光、标记基因、启动子序列等均可对其进行监测。 1997 年,Mahaffee 等对环境 释放后荧光假单胞菌的检测方法进行了研究。结果发现:采用平板计数得到的 GEM-8 和 R34 的数量大大低于野生菌株 89B-27 的数量,也低于 GEM-8 和 R34 用 IFC 法检测的数量。表 明传统 的标记容易低估环境中的微生物数量,从而推测也可低估活体微生物及植物定殖微生 物的数 量[2] 。这也从另一个侧面提示 ,分子检测有可能更准确 的反映 出工程菌的数量。 目前对于遗传工程菌和重组 DNA 的环境监测主要采用培养法或免培养法。 1. 基于培养的监测方法 1.1 利用选择性培养基监测 GMM 1.1.1 根据 GMM 上带有的特殊抗生素特性 , 如卡那霉素 (Kanamycin, Kan)、壮观霉素 (Spectinomycin, Spc )、潮霉素 (Hygromycin B )等抗生素基因,抗重金属等特点采用相应 [1] 培养基进行筛选,将减小背景干扰 ,从而增加监测的可能性 。 1.1.2 营养底物利用基因:甘露糖-6-磷酸异构酶基因(Mannose-6-phosphate isomerase, MPI)是 1999 年报道 的选择基因,其编码产物可以将不 能为植物所利用的碳源转换为可以利 用的 6-磷酸果糖 。当在培养基中只有 6-磷酸甘露糖作为唯一碳源 时,只有含有 MPI 基因 的 转化组织或细胞可以生长 ,而未转化部分因为不能利用而停止生长 ,直至死亡 。MPI 基因在 作者简介:张霞(1978-) ,女 ,汉族 ,硕士 ,主要从事遗传重组微生物及其生物安全性研究。 Tel:0311-3014618, Email: zxx7812@ 1 甜菜 、玉米和小麦 的遗传转化实验上获得了 良好的结果。 1.2. 利用报告基因监测 1.2.1 生化显色标记基因 β-半乳糖苷酶基因(lacZ ): β-半乳糖苷酶基因是 由 Drahos 等于 1986 年第一个采用的 非抗生素标记基因。带有该基因的微生物在含有底物 5-溴-4-氯-3-吲哚-β-半乳糖苷 的平板上 或溶液 中使菌落变成蓝绿色 。Katupitiga(1995)采用 lacZ 基因标记研究了 固氮螺菌在小麦根 际的定殖动态 。但是在常见 的微生物和植物中均有 β-半乳糖苷酶 的背景活性,使其应用效果 有一定影响 。与 β-半乳糖苷酶基因存在相似问题 的还有碱性磷酸酶基因 (phoA )和邻苯二酚 2,

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