基因芯片实验设计探讨（I）.pdfVIP

科技 science topics 专题       彼得•杜拉克 (Peter F. Drucker) 的名言「效率 生物重复性是指研究人员在收集生物样品时， 是把事情做对；效用是做对的事情」，基因芯片 可能因组织位置、个体差异、实验环境偏差…等导 (microarray) 数据结果能否发挥最大的效用在于一 致同一条件的生物样品实验产生截然不同的结果。 开始是否做了正确的实验设计，依研究目标进行分 例如研究小鼠的肝脏基因差异，A 老鼠与B 老鼠即 析，从中撷取最想看的结果并厘清疑虑。华联生技 使是以相同条件饲养及用药，仍会有先天上的个体 本期与八、九月的快讯将介绍基因芯片实验设计的 差异，意即A 老鼠与B 老鼠的肝脏基因表现不会完 种类，继续为您的实验扮演最佳效率的角色。 全相同；或是细胞培养的实验，A 盘细胞与B 盘细 胞虽用相同的培养及用药条件，但可能两盘细胞在 培养箱的位置不同，例如A 盘细胞比较靠近温度、 基因芯片实验设计种类 CO2、光源…等控制器附近，使得A 盘细胞与B 盘 一般而言，基因芯片实验设计须针对基因芯片 细胞的基因表现有差异。为了确认并降低这种个体 重复性及生物性重复进行设计。以最佳的实验设计 差异，应进行生物重复性试验，即指多养几只老鼠 来说，三重复的基因芯片实验结果是从科学研究角 或几盘细胞，每只老鼠或每盘细胞皆进行一次芯片 度最具可信度的，因各种实验中所使用的试剂、仪 实验，最后结果分析时只挑选在生物性重复内呈现 器、环境、人..等各方面皆会使实验结果具有某种 相同趋势的基因。如果生物性重复的芯片结果差异 程度的量测不确定度，三重复的实验设计即是为了 太大，可能代表有不知名的因素干扰个体老鼠或细 降低这些量测变异。但如因研究经费之限制或仍在 胞的生理或心理环境，需重新检查实验设计，并另 寻找方向，亦可选择单片或双重复，先从茫茫的基 做一次生物性重复实验。 因海中寻找出隐约的方向，如果方向是令人兴奋 华联生物科针对常见的实验型态，将实验设计 的，再考虑投入更多经费，进行更为严谨的多重复 与分析归成六大种 (表一) ，本期将先介绍 A1 与 芯片验证实验。 A2 。 1 华联快讯 2012.07 科技 专题       复杂，以肺癌为例，依癌细胞大小粗分成小细胞肺 癌和非小细胞肺癌；两种肺癌又可依癌细胞种类分