中国芽胞杆菌的资源分类及其系统发育研究（一）立项依据.docxVIP

中国芽胞杆菌的资源分类及其系统发育研究（一）立项依据与研究内容（4000-8000字）： 项目的立项依据（研究意义、国内外研究现状及发展动态分析，需结合科学研究发展趋势来论述科学意义；或结合国民经济和社会发展中迫切需要解决的关键科技问题来论述其应用前景。附主要参考文献目录）；研究意义芽胞杆菌属通常简称为芽胞杆菌，它是一种重要的微生物资源，研究芽胞杆菌属的分类正是因为它有着重要的应用价值，由于产芽胞这一特性，使得其成为各研究领域研究者关注热点。芽胞杆菌可产生抗逆性极强的内生芽胞来度过不利的生长条件，因此分布极为广泛，特别是在极端环境中常有芽胞杆菌的踪迹，在生态系统中起到极其重要的作用。芽胞杆菌种类繁多，资源丰富，可产生多种多样的活性物质，占据了医用活菌制剂的90%以上，在工业、农业和医学等领域有着重要的经济价值。鉴于芽胞杆菌的重要应用价值，发达国家已建立了完善的资源收集和研究体系。丰富的标准菌株资源，为芽胞杆菌新种的鉴定和分类体系的研究提供了重要的基础作用。韩国微生物保藏中心KCCM保存了完整的芽胞杆菌标准菌株，美国的ATCC和德国的DSMZ均保存收集了大量的芽胞杆菌标准菌株。从近10年来发表的芽胞杆菌新种记录来看，大多数皆为发达国家。单单从发表新种的数量上来看，韩国和日本发表的芽胞杆菌新种相对较多，韩国几乎每年都有大量新种发现，在IJSEM上发表的论文总数所占比例最大，其次为日本。近十年我国发表的新种占总数的不到10%，尽管我国在IJSEM上也发表了不少了新种（刘国红等，2011），但作为微生物学基础研究的重要领域，主要从事分类相关的实验室和研究人员却很少。我国幅员辽阔，自然环境多样，芽胞杆菌资源蕴藏丰富，但系统性的资源发掘工作非常缺乏。据周宇光等主编的《中国菌种目录》记载，保存在中国各大保藏中心的芽胞杆菌属的标准菌株仅25种，其近缘属10个有17种菌，这些数量对芽胞杆菌的分类研究来说是远远不够的。芽胞杆菌属从建立到现在经历了一百多年的研究历史，由芽胞杆菌属发展到现在的52个近缘属（Euzéby, 2012），其分类地位经历天翻地覆的变化，尽管我国地大物博，资源丰富，相对于发达国家，而我国在芽胞杆菌分类方面研究几乎一片空白，根据近几年来国家基金资助项目概况分析中可以看出国家对芽胞杆菌资源利用的资助很多，但是对其分类研究的资助却没有。目前，利用与德国波恩大学的合作，我们实验室已从德国微生物菌种保藏中心DSMZ引进芽胞杆菌模式菌株165余种，其中芽胞杆菌属151种，占总数的59%，其他近缘属8个属共14种菌。因此，本实验室拥有大量的芽胞杆菌模式菌株，为本项目的研究打下坚实的基础。本项目采用多相分类法研究中国芽胞杆菌资源分类及系统发育，同时建立完整的芽胞杆菌脂肪酸数据库，寻找一种芽胞杆菌快速鉴定方法。现在的商业微生物脂肪酸鉴定系统Sherlock MISI系统仅包含芽胞杆菌模式菌株仅有几十种，远远不能满足研究需要。申请者近15年来致力于芽胞杆菌的分类鉴定和功能开发，在全国各省采集的不同生境土壤样本5400份，分离到8000余株芽胞杆菌菌株，多相分类法的技术我们已掌握，且拥有进行该项目的所有设备。为了弥补我国在芽胞杆菌分类方面的工作，与国际分类接轨，本项目研究芽胞杆菌系统发育具有重要的战略意义，且我们也具有承担本项目的研究能力。国内外芽胞杆菌属的研究现状及发展动态芽胞杆菌属分类系统的演化，芽胞杆菌属由一大类细菌组成，好氧或兼性厌氧，细胞呈直杆状，常以成对或链状排列，具圆端或方端。细胞染色大多数在幼龄培养时呈革兰氏阳性，芽胞椭圆、卵圆、柱状、圆形，能抗许多不良环境。芽胞杆菌属分类是一项非常复杂极其庞大的工作，1872年德国科学家Cohn根据细菌形态特征建立了芽胞杆菌属，并将枯草芽胞杆菌作为该属的模式菌株。研究初期，由于科学技术的落后，很多生理生化和遗传学特征迥异的细菌都曾被归入芽胞杆菌分类范畴内。经历了漫长的形态学和生理生化指标分类研究，芽胞杆菌分类地位逐渐明确并清晰起来，芽胞杆菌分类系统也经历了天翻地覆地变化。《伯杰氏细菌鉴定手册》(Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology)第八版（布钦南等，1984）采用的芽胞杆菌分类系谱列数了48种芽胞杆菌（其中26个在当时没有得到广泛认可），大部分归在芽胞杆菌科Bacillaceae的芽胞杆菌属Bacillus。1991年，Ash等首次利用16S rRNA将51株芽胞杆菌分为5大类群，许多种芽胞杆菌逐渐从芽胞杆菌属分化出来，另建属。如Bacillus halophilus, Bacillus marinus, Bacillus marismortui, Bacillus salexigens, Bacillus dipsosauri和Bacill