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第二讲 转基因的方法
几个基本名词
限制性内切酶
限制酶的全称是限制性内切核酸酶,顾名思义,这是切割核酸的酶,可以把一切个分子切割成两段或若干段,但这种酶在核酸分子内切割时又不是乱剪乱,是有限制的。
限制酶把DNA分子分开的地方,叫做酶切位点,凡是称为酶切位点的DNA片段,核苷酸对的排列比较特殊,那就是一条链上的核苷酸排列顺序正好是它的互补链的180 倒转。由于这个特点,酶切位点的这段DNA所包括的两条互补链,都顺着一个方向读,即从5 3 ,或3 5 读,两条链的顺序是完全一样的。例如有一段DNA,上面的核苷酸对是这样的
5 GAATTC 3
3 CTTAAG 5
你从5 3 读,上下两链都是G-A-A-T-T-C。这种排列顺序特称为“回文序列”(图2.1)。
限制性内切核酸酶的种类很多,一种内切酶只能在一种回文序列处剪开DNA,就是说不同的内切酶,具有不同的酶切位点。(表2.1)。
表2.1 一些常见的限制酶的识别位点
限制酶 识别位点 限制性 识别位点 ApaI
Bg1II
ClaI 5G GGCC C3’
3’C CCGG G 5’
5’ A GATC T 3’
3’ T CATC A 5’
5’ AT CG AT 3’
3’ TA GC TA 5’ SmaI
TagI
Sau961 5 CCC GGG 3’
3’GGG CCC G 5’
5’ T CG A 3’
3’ A GC T 5’
5’ G GNC C 3’
3’ C CNG G 5’ * 表中 N 表示任意碱基。
双链被内切酶切开后,必然留出两个单链末端,一段具有5 GAATTC 3回文序列的双链DNA,被一种称为EcoRI的限制酶从G-A之间切开后,就留下两个-T-T-A-A-单链末端。这种末端是不稳定的,单链上的核苷酸全按照A接T、G接C这样的原则去粘连上对方的核苷酸,为此,把单链末端特称为“黏性末端”。
同一种内切酶只能在一种回文序列处切开DNA双链,同一种酶切开双链后留下的黏性末端是相同的,而有时候,内切酶虽不同,却也会把双链DNA切成相同的单链末端,这种切出相同黏性末端的不同酶,互相称为同尾酶。
连接酶
连接酶的全称是DNA连接酶。一看就知道,这种酶的作用就是把那些被内切酶切成一段段的DNA连接起来,这种酶好像是专门用来连接DNA的“浆糊”或“胶水”。
连接酶也有不同种类,黏性大小也因种类而异。目前称得上连接DNA“强力胶”的连接酶是T4DNA连接酶。
同一种内切酶切成的DNA片段被连接酶连成一体后,如果再用这种内切酶切割,那么又会再次切成原来的两段,而连接酶把同尾酶切成的两段DNA连成一体后,那么连接处就不会被其中任何一种同尾酶再度切开。
连接酶也会把平头末端的DNA片段连在一起。
载体
载体的完整名称是基因载体。基因要转移,尤其是远距离的转移,没有运输工具是不能达到目的的。目前能把基因运往“异国他乡”的运载工具主要是质粒和噬菌体。
质粒(plasmid)是什么?原来质粒本身也是一个DNA分子,但是作为质粒的DNA分子比一般作为染色体组成物的DNA分子要小得多,而且质粒DNA分子是一个环状分子。这种环状的DNA分子主要在细菌、蓝藻细胞内。质粒能自由进出细胞,质粒DNA的基因也能决定性状,质粒DNA在细胞内也能复制。像大肠杆菌这样的细菌因为有质粒的存在会表现出新的性状,而新性状会因质粒离开细胞而消失。如质粒DNA上有一个抗青霉素的基因,那么,可以预料,当质粒进入大肠杆菌后,大肠杆菌就抗青霉素,而质粒离开大肠杆菌后,大肠杆菌就会被青霉素杀灭。
由于质粒本身具备进出细胞的能力和自我复制的功能,于是就有人想让质粒来运载基因了。经过摸索,最终得出的结论是,质粒确实能作为运载基因的工具,但只能运载分子结构小于10kb的基因,10kb就是10千碱基,即一万个碱基对的DNA,对质粒来说还运得动。当比一万个碱基对还要大时,质粒就无能为力了。
现在,已有许多质粒被用来运载基因了,虽然质粒的种类不同,但不同种类的质粒却有许多共同点,这些共同点是:要有回文序列(酶切位点),要有抗性基因,要有复制开始的核苷酸序列(复制起始点)。
一种名为pBluescript的质粒(图2.2),标明MCS的地方,就是酶切位点。在这里集中着多个酶切位点,也就是说,在这里有多个回文序列,MCS的中文意思是多克隆位点,英文全称是Multiple clone site。
内切酶能在MCS处把环状质粒切开,并留下两个黏性末端,如果用同样的内切酶去切割其他来源的DNA,那么势必会把其他来源的DNA切成具有两个与质粒相同的黏性末端,如果两个黏性末端之间的DNA中正好有一个能生产蛋白质的基因,而这种蛋白质正好是人们所需要的,那么这个基因就
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