宫颈癌及癌前病变的全基因组表达谱分析及下调表达候选基因鉴定.pdfVIP

第36卷 第 7期 新 疆 医科 大 学 学 报 Vo1．36 No．7 2013年 7月 JournalofXinjiangMedicalUniversity July．2013 · 民族肿瘤学 · 宫颈癌及癌前病变的全基因组表达谱分析及 下调表达候选基因鉴定 阿丽叶古丽 ·艾皮热 ，西尔扎提 ·苏来曼 ，刘开江 ，吐尔逊帕夏 ·吾布力卡 ， 玛依拉 ·卡米力江 ，AbuliziAbudula。 (新疆医科大学 基础医学院生物化学教研室，附属肿瘤医院妇科，。新疆地方病分子生物学重点实验室，乌鲁木齐 830011) 摘要 ：目的 探讨维吾尔族妇女宫颈癌组织特异的下调表达基 因谱 ，建立基于下调表达基 因的宫颈癌早期诊 断方法 。方法 收集维吾尔族妇女宫颈病变新鲜组织标本 72例 ，其 中宫颈鳞癌 (cervicalsquamouscellcarcino- ma，CSCC)25例 ，宫颈 内上皮瘤变(cervicalintraepithelialneoplasia，CIN)22例 ，正常宫颈组织 (normalcervix，NC) 25例 。选择 2O例组织标本 (CSCC7例 ，CINllI6例 ，NC7例)，提取组织 RNA，通过人类全基因组表达谱芯片及生 物信息分析 ，筛选宫颈癌及癌前病变(CIN)特异性下调表达候选基因。通过对 CSCC与正常对照 (NC)组的基 因差 异表达谱进行 比较分析 ，选取 1O种差异表达倍数较高的候选基因，利用 72例宫颈病变组织 RNA，对 10种下调表 达候选基 因的表达水平进行半定量 RT—PCR鉴定，确定宫颈癌及癌前病变与该基 因表达水平变化 的关系 。结 果 以2倍及 以上表达差异为量化标准 ，有下调表达候选基因 112种 。72例 宫颈病变组织 RNA 的半定量 RT-PCR 筛查分析 ，发现在 CSCC与正常对照组之 间，F0SB、DNASE1L3、SCARA5、EGR1、ABI3BP、FOS、KLF4、RHOB、 IER2和 ID4等 1O种下调表达基 因的差异均有统计学意义 (P0．05)。DNASEIL3、EGR1、FOS、KLF4和 IER2 等 5种基 因的表达水平差异在 CIN与正常对照组之间有统计学意义 (PO．05)，但是除了FOS基因外，其余 4种 基因表达在 CSCC与 CIN组之间无差异 (P0．05)。结论 维吾尔族妇女宫颈癌发病进程可能与一系列基因的 下调表达密切相关，而 DNASELL3、EGR1、FOS、KLF4和 IER2等 5种基 因的表达水平变化可能成为宫颈癌早期 预警指标 。 关键词：宫颈鳞癌；维吾尔族妇女；下调表达基因；人类全基因组表达谱芯片 中图分类号：R730．2；R737．33 文献标识码 ：A 文章编号：1009—5551(2013)07—0912-06 W holegenomeexpressionprofileanalysisofcervicalcanceranditsprecursors anddetectionofcandidatedownregulatedgenes AliyeguliAipire，XierzhatiSulaiman ，LIUKaijiang，TuerxunpaxiaWubulikasimu ， MayilaKamilijiang ．AbuliziAbudula’ (DepartmentofBiochemistry，CollegeofBasicMedicine，DepartmentofGynecology， AffiliatedTumorHospital，。KeyLaboratoryofMolecularBiologyandEndemicDiseases， XinjiangMedicalUniversity，Urumqi830011，China) Abstract：Objective Tostudythegeneexpressionprofile