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化合物潜在作用靶标的预测 凡默谷生命科学领域讲座 AurPROFILER 在药物研发中的应用 2011 年 7 月，第 6 期 首页 产品 解决方案 培训中心 与我们联系 化合物潜在作用靶标的预测 药物潜在靶标的识别对于早期药物分子的研发、天然产物的生物活性、安全性评价和老药新用等领域都有着非常重 要的意义，但是受制于通量、精度和费用的影响，实验手段的应用难以广泛开展。作为一种快速而低成本的手段，计算 机辅助的靶标识别技术的开发正在受到越来越多的重视，发展快速、精确、全面的靶标识别预测方法对于靶向性药物开 发、天然产物作用机理探讨、药物潜在毒副作用的发现及老药新用等领域具有十分重要的意义。 目前，越来越多的靶标预测技术已经被开发并应用于药物研发，如反向分子对接方法、反向药效团匹配方法、药物 -靶标结合位点检索技术(PBSDD 技术)及药效特征匹配搜索方法(AurPROFILER 平台)等。 通过反向对接方法预测化合物作用靶标是目前应用较广泛的一种方法，但是存在一定的局限性，如靶标库的构建需 要受体三维结构已得到解析、计算时间长，并且无法得知化合物与作用靶标发生何种效应(抑制、拮抗、激动等) ；反向 药效团匹配方法所耗费的计算时间较短，但是要搭建一个精准的药效团模型，需得到该化合物与具体靶标的晶体复合物 结构；药物-靶标结合位点检索方法需要化合物与靶标结合位点信息，因此在应用上受到局限。 药效特征匹配搜索方法，是基于相似化合物具有相似活性的原理进行靶标预测，AurPROFILER 正是基于此原理进 行靶标预测的工具。相对于其他靶标预测方法，AurPROFILER 具有以下优势： 1. 数据全面。3000 多个药物靶标和对应的 300 多万条化合物活性数据，为靶标预测提供广阔的预测范围； 2. 操作简便。仅需提交化合物的结构式，即可进行靶标预测工作； 3. 速度快。只需 1~2 分钟时间即可完成一个化合物对 3000 多靶标可能的作用预测； 4. 可预测作用细胞株。AurPROFILER 不仅可预测化合物潜在的作用靶标，还可预测潜在的作用细胞株。 AurPROFILER 功能简介 AurPROFILER 是由 Aureus Science 公司研发 的一款药物靶标活性数据库应用平台，为您提供热 图的形式显示化合物与靶标之间的作用强度，可用 AurPROFILER 应用平台 于： • 预测未见报道的新化合物的作用靶点或细胞 株，指导测活实验； • 快速查询化合物已报道的作用靶点或细胞 株； • 快速查询与特定靶标或细胞株作用的在研化 合物信息。 AurPROFILER 应用案例 1——天然产物潜在靶标预测 全新天然产物 Poricotriol A 的作用靶标及细胞株预测 背景：从中药中分离提取得到全新化合物 Poricotriol A ，但是潜在药理作用不明确，没法合理指导测活实验开展。 目的：预测全新三萜类天然产物 Poricotriol A 的潜在生物活性，指导下一步的测活实验开展。 结果：预测结果表明，Poricotriol A 对白血病细胞