Tim基因和组蛋白基因进化的初步研究.pdfVIP

摘要 磷酸丙糖异构酶(triosephosphateisomerase,Tim)是在生物的糖酵解途径 中起重要作用的一类酶.它催化二经丙酮磷酸((DHAP)和甘油醛-3-磷酸 (G-3-P)之间的相互转化.在生物间的变异相对较大.组蛋白(histone)是真核 生物核小体的重要组成部分，它同时对真核生物的荃因表达与调控起重要作 用。在生物间的保守性较高。为了对这两类各具特色的基因的进化特点进行 考察，我们选择了在进化上处于关键地位的一些低等单细胞真核生物作为研 究对象，测定了蓝氏贾第虫的Tim墓因和组蛋白H3,H4墓因，阿米巴的Tim 荃因和眼虫的组蛋白H3墓因。并结合己报道的其他生物的相同基因序列， 对Tun墓因我们分8个生物类群对其进行排序，对组蛋白荃因我们分三个生 物类群对其进行排序和密码子使用频率的计算。 对Tim基因进行的排序显示，蓝氏贾第虫Tun与其它真核生物Tim的氨 基酸 列同源性为42.2-58.8%,溶组织阿米巴Tun与其它真核生物Tim的氨 基酸序列同源性为37.3-50.4%。在所有生物中Tim有10个氨荃酸位点高度保 守，分别为Asn10,Lys12,Gly73,Thr76,Gly77,His96,Glu98,Arg100, Cysl21和Gly240，其中Lys12和His%为已报道关键活性位点，另外8个为 本研究首次发现.同时在三个功能区域Alal64-Glyl74,lle207-Ser2l2和 Leu242-Leu248存在变异。且变异主要在原细菌中发生.表明真核生物Tim与 真细菌Tim关系较近而与原细菌Tun关系较远。 对组蛋白荃因进行的排序显示，蓝氏贾第虫H3与其它真核生物H3氨基 酸序列同源性为34.6-57.7%.H4为35.5-69.0%.腐生眼虫H3与其它真核生 物H3氨基酸序列同源性为37.2-75.2%。组蛋白在单细胞生物间的变异较多 细胞生物间的大。原细菌组蛋白亲缘蛋白与H4的关系较H3近。另外，密码 子的使用频率显示，单细胞生物在密码子的选择上与多细胞生物基本一致， 原细菌则与二者表现出较大差异。于丫一 本研究为首次在较大生物类群范围内从进化的角度对Tun基因和组蛋白 基因进行的研究. 关键词:Tun基因，组蛋白基因，低等单细胞生物，进化 Triosephosphate isomerase (Tun)catalyzesthe interconversion of dihydroxyacetonephosphateandglyceraldehydes3-phosphateandhasan importantroleinglycolyticpathway.Histonesareimportantcomponentsof nucleosomesandplayacrucialroleingeneexpressionandregulation.Toclarify theevolutionarycharacteristicsofthetwodifferentgenes,wesequencedTim gene,H3geneandH4geneofGiardialambiaandTungeneoftheEntamoeba histolytica,andH3geneofAstasialonga.Wealsocollectedother38Tungene sequencesand57H3and50H4genesequencesrfomGenBank.Thenwealigned alltheTimgenesequencesbydevidingthemintoeighttaxaandasawhole.All Histongeneswerealignedbydevidingthemintothreegroupsandasawhole, alsocodonusagerfequenciesofthethreegroupswerecalculated. ComparisonoftheTimaminoacidssequencesbetweenGiardialambiaand 。出“eukaryotesshowedthatthehomologywas42.2-58.8%,andthehomologyof theEntamoebahistolyticaandothereukaryoteswas37.3-50.4%.Amongallthe organisms,thereweretenhi