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第一军医大学博士论文
摘要
结构蛋白,S蛋白是冠状病毒表面最大的结构蛋白,在病毒与宿主细胞
表面受体结合及介导膜融合并进入细胞的过程中起关键性作用。既往对
冠状病毒s蛋白的研究表明,s蛋白是SARS.CoV与宿主细胞膜受体的
结合部位,包含重要的中和抗原表位,是进行抗SARS疫苗设计的重要
位点。s蛋白突变率较低的冠状病毒,通过s蛋白己经获得了有效的疫
菌。SARS—CoV的S蛋白的氨基酸突变率不高,通过S蛋白很有希望获
得有效抗的SARS疫苗。
目的:本实验将根据SARS.CoVS蛋白的序列,通过网络共享软件
对s蛋白的二级结构、理化性质和s蛋白的抗原表位进行生物信息学预
测与分析,并根据预测结果设计并合成出一系列的候选抗原表位多肽进
行免疫学研究。通过将合成的抗原表位多肽与SARS康复病人的血清反
应,以及在动物体内的免疫反应,以发现s蛋白的抗原表位,从而为基
于s蛋白的亚单位疫苗深入研究打下基础。
and
方法:利用Expasy提供的网络共享工具软件Proteomics
tools对s蛋白的二级结构预测,信号肽切割位点,穿
sequenceanalysis
膜螺旋,N.糖基化位点,0.磷酸化位点, 半光氨酸结合状态,亲水性,
PREDICTINGANTIGENICPEPTIDES软件对B细胞抗原表位进行预测。利
MHC—I和MHC.II限制性的T细胞抗原表位预测。根据B细胞抗原表
位预测结果设计并合成抗原表位多肽。抗原表位多肽采用Fmoc-butyl固
相合成侧链保护策略,在多肽合成仪上进行合成,HPLC进行纯化,电
ionization
SOI/rCC,ESI)进行结构鉴定。抗原表
喷雾电离法(electrospray
第一军基大学德士论文
位多月太采用间接ELISA法测定SARS相关冠状病毒抗原表位肽与SARS
病人』靓清中抗体的反应。根据抗体反应呈阳憾的抗原表位多肷,综合S
蛋白的:二级结构和理化性质及T细胞抗原表位鲍预测与分橱结粜,设计
著禽袋灏匏藐覆多获。缘会设计懿撬覆多簸采爝皮下注麓豹方式对凝蟊
兰家兔进行免疫。角间接ELISA法检测免疫蒙兔产生抗体的滴度。
结果:预测结果表明,在s蛋白中存在一个球状结构区域(s1区)
和三个螺旋区(s2区),螺旋结构分别位于残潦729—769,880一1015,
1163一lt84。S蛋白静信号骚甥害l位点位于K一漩弱13像氨基酸残蘩(Gly)
和i4位氨基酸(Set)蔑鏊之间。S蛋自在Ii96—1218之滴存在…蔽穿膜
螺旋结构,1—1195段处于胞膜外,1219—1255则在胞膜内。S鬣白共
有23个糖基化位点,其中有lO个糖基化的可能性很高,7个糖熬化程
度一般,6个糖基化程艘较僬。S蛋自共有196个。-磷酸化位点,包括
%个Ser翥100令Thr粒磷酸纯谴点。赝骞这蟹经点磷酸识戆可缝穗都
不商。s蛋白的39个Cys中只有4个形成二硫键的可能性商。它们分别
是288,725,731,822位的Cys。S蛋白共存在lO个暴露的片段,即
t40,1202—1242。S虽自主要鸯七个萦隶蠖
--690,789--825,1095一l
T细胞抗原表位的预测结聚表明,共有11个肽段被预测为HLA—1分子
的混杂性抗琢表位,共有9个敢段被预测为HLA—11分子的混杂憋抗原表
位,菸有7令丸袋段被鞭溅为HLA--A2耱雾控藐嚣表位。B缨熬撬燕
表位预测结果表明,S.鬣自共存在氨基酸残蕊数目不小于7的抗原表位
位点61个。根据B细胞抗原表位预测结果共设计出47个抗原表位多肽,
并合成了35个抗原袁位多肽。用ELISA检测,有六个抗原表位多肽与
SARS瘫复病人盘蘧反应璺疆性臻累,帮S曩s—14、s—17、s一20、N-5
第一军医大学博士论文
和N.19。综合设计的抗原多肽SV.1和SV-5在家兔体内产生了较强的免
疫反应,其免疫后的家兔血清可以检测到SV一1和SV-5的特异性抗体。
SV.7和SV-10产生的免疫反应很弱。
结论:预测和分析了SARS—C
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