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斑马鱼中siRNA介导的RNA干扰及DECl/Sharp2/Stral3基因的克隆和功能研究
斑马鱼中siRNA介导的RNA干扰研究
摘要
RNA干扰是指通过导入一段与内源基因同源的双链RNA序列(dsRNA),
使内源mRNA降解,从而导致转录后的基因沉默。RNA干扰广泛存在于细菌、
植物和动物中。脊椎动物中,长链dsRNA能引发干扰素反应而引起非特异性的
应用于基因功能研究。目前斑马鱼siRNA于扰方面的报道极少。本文中,我们
开展了U6启动子驱动的siRNA介导的斑马鱼RNA干扰研究。选择功能明确且
Mitfb和GFP报告
与表型相关的4个斑马鱼内源基因Myf5,D193,Mitfa(Nacre)平ll
基因为靶基因,分别选2~4个靶位点,构建U6启动子驱动的siRNA表达载体,
显微注射至斑马鱼受精卵,追踪观察胚胎发育。根据表型分析结合整胚原位杂交
结果,探测siRNA对斑马鱼体内基因表达的影响。结果表明:1.)U6启动子驱
动的siRNA能抑制斑马鱼靶基因的表达,但抑制作用不完全。2.)在所选的靶位
点中,siGFP对斑马鱼体内的GFP表达无明显的抑制作用;3.)针对不同的靶位
非特异性,有待进一步探索。
中图分类号:Q34
斑马鱼中siRNA介导的RNA干扰及DECl/Sharp2/Stral3基因的克隆和功能研究
斑马鱼DECl/Sharp2/Stral3基因的克隆和功能研究
摘要
细胞分化,增殖和凋亡过程中起重要的调控作用。DECI参与哺乳类生物钟的调
控,是哺乳类的第5类生物钟基因。本文克隆了斑马鱼的DECI基因,进行了生
物信息学分析,检测了LD周期下斑马鱼胚胎发育阶段DECl的表达和成体眼中
011498.2),
人(NM
极其相似的保守结构域,属于bHLH转录因子DECl的家族成员。2.)斑马鱼胚
胎发育早期直到4体节期,DECI普遍且强烈表达,随着发育的进行,DECl在
眼,体节,血岛和松果体等多种组织中表达;至Pec—fin
stag(60hpf),体节等组
织中的DECl表达减弱,至Protruding—mouth
在松果体和视网膜色素上皮中。DECl在斑马鱼成体眼中呈现有规律的表达。3.)
斑马鱼DECl的过表达和反义抑制都严重影响胚胎发育,造成胚胎体短,体节弯
曲,心血管发育异常并且发育严重迟滞的现象。提示1.)DECl很可能参与斑马
鱼生物钟的调控,是斑马鱼中的一类生物钟基因;2.)DECl参与斑马鱼胚胎发
育过程中多种组织器官包括体节和心血管系统等的细胞分化。
中图分类号:Q34
斑马鱼中siRNA介导的RNA干扰及DEcl/shar口2,stral3基因的克隆和功能研宄
inZebrafish
SiRNA.MediatedRNAInterference
Abstract
RNA a mechanism
interference(RNAi)isposttranscriptionalgenesilencing
double—stranded causes ofits
triggered RNA(dsRNA)anddegradation
by
mRNAs.RNAihasbeenobservedinawide of
homologous rangeeukaryotes,
andanimals.In ds
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