密码对的偏爱与基因组进化的相关性分析.pdfVIP

第7卷 第2期 生 物信 息 学 Vol_7 N0．2 2009年06月 ChinaJournalofBioinformatics June．20o9 密码对的偏爱与基因组进化的相关性分析 王芳平 ，李宏 ，刘国庆，李瑞芳 (内蒙古大学物理科学与技术学院，呼和浩特 010021) 摘要：以5种真核、l5种细菌、1O种古菌生物基因组为样本，对密码对使用偏好性指标 r与密码对随基因组进化的指标。之间 作线性分析，发现部分密码对的r值与a之间有显著的线性关系；密码子第三位点与紧邻密码子第一位点的双碱基 (cP3cA1) 使用与基因组进化有关。结果进一步肯定了密码对的使用与基因组进化存在相关性，同时从密码对使用的角度揭示了真核 生物、真细菌、古菌的基本差别。 关键词：密码对；基因组进化；线性回归；F(a，)分布 中图分类号：Q61 文献标识码：A 文章编号：1672—5565(2009)一02—150—06