分枝杆菌临床分离株菌种的分子鉴定.pdfVIP

· 182 · 2012年 3月 20日第 3l卷第 2 · 论 著 · 分枝杆菌临床分离株菌种的分子鉴定 邵永珍 范长龙 王娟 纪滨英 全保燕 李迪 江洋深 凌虹 摘【要】 目的 建立对临床分离分枝杆菌菌种快速、精确鉴定的方法学平台，了解分枝杆菌菌种的分布， 为结核分枝杆菌 (MTB)和非结核分枝杆菌 (NTM)病临床精确诊断和有效治疗提供依据。方法 330株分枝杆 菌分离株来 自于 2007年 5月至 2008年 12月在哈尔滨市胸科医院诊断为结核病的住院患者 。菌株灭活后提取 基因组DNA．采用PCR方法，结合PCR一限制性片段长度多态性 (RFLP)和DNA序列测定方法进行菌种精确鉴 定。结果 330株临床分离菌株全部精确鉴定，其中328株[占99．4％(328／330)]为结核分枝杆菌复合群(MTBC)， 2株 [占0．6％(2／330)]为NTM。328株MTBC中，MTB326株 、非洲分枝杆菌 ( afr~na)1株、田鼠分枝杆菌 ( microti)1株 ，分别 占MTBC的99．4％(326／328)、O．3％(1／328)和 0-3％(1／328)。经测序和基 因组同源性分 析发现 ，2株 NTM为胞 内分枝杆菌(MAC)，与 MAC的同源性分别为99％和 93％，2株菌之间的同源性为 93％。 结论 建立了临床分离分枝杆菌菌种快速鉴定的方法学平台，临床诊断为结核病的患者MTB比例 占绝对优势， 也发现有 African、 microti和 NTM感染。 【关键词】 分枝杆菌属； 菌种鉴定； 聚合酶链反应； 序列比对 M olecularidenfificafionofMycobacterium clinicallyisolatedstrainsofbacteria SHA0 Yong-zhen ． J7、7 Chnag-long，WANGJuan，JIBin—ying，QUANBao-yna，LIDi，JIANGYang-shen，LINGHong． Heilon~inag ProvincialKeyLaboratoryforInfectionandImmunity．KeyLba ofEducationBureauofHeilon~iangProvincefor Etiology，DepartmentofMicrobioloyg，HarbinMedicalUniversity，Hrabin150081，China Correspondingauthors：LINGHong，Email：lin#@em~．hrbmu．edu．cn；flANGYang-shen，DepartmentofGeneral Surgery，Dalina UniversityXinhuaHospital，Dalina 116021，Email：cmulw@sincacom A【bstract】 Objective ToestablishthemethodologyforidentificationofclinicalisolatesofMycobacterium andtoidentifythedistributionofMyeobacteriumspeciesinhospitalizedpatientswithtuberculosisinHeilongjiang province．ItwouldprovidethebasisforaccuratediagnosisofinfectionswihtMycobacteriumtuberculosis(MTB)and ／．／on—tuberculousMycobacterium (NTM)aswellasofreffectivetherapy．Methods Threehundredandthirty Mycobacterium isolatesfrom 330tuberculosispatientshospitalizedandclinicallydiagnosedinHarbinChestHospital from May2007toDecember2008werecollected．GenomicDNA rfom theisolateswasextractedafterinactivationof Mycobacterium．M