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- 2017-09-04 发布于安徽
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深度测序数据表现和表换的全能格式及其编辑工具 中文摘要
深度测序数据表现和交换的全能格式及其编辑工具
中文摘要
随着下一代测序技术的飞速发展,产生了数以万计的数据,下游的分析软件也呈
指数增长。然而,这些软件之间的标准不统一,往往定义了自己的数据格式。因此,
在多个软件间进行数据交换就显得尤为困难。本文为解决这个难题,从两个层次逐步
深入。首先,开发出了一款界面友好,功能强大的数据格式转换软件。但是,数据格
式转换仍然存在诸多问题,如数据丢失,耗费时间等。接 ,本文提出了一种用于下
一代测序的通用数据格式NGSML。使用NGSML格式就可以解决大量数据间的交换
与显示问题,极大地方便研究人员将精力专注于所研究的核心问题上,而忽略数据格
式转换等繁琐的问题。同时,为了便于NGSML格式的操作,我们开发出了一款易于
使用的编辑软件,方便用户编辑和展示NGSML文件。最后,本文将NGSML格式应
用到了具体的问题中。在POMA软件的数据存储中使用了NGSML数据格式,展示
NGSML格式的强大功能和高度的可扩展性。
关键词:下一代测序,数据格式,格式转换
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