改进自组织映射(SOM)蛋白质折叠算法和计算实现.pdfVIP

改进自组织映射(SOM)蛋白质折叠算法和计算实现.pdf

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J. Sys. Sci. Math. Scis. 25(5) (2005, 10), 562–573 (SOM) ∗ ( 100080) HP HP NP HP (TSP) F-W HP HP SOM HP MR(2000) 90C39, 90C90, 92C40 1 1.1 “ ”. Levinthal [1]: (Homologous Modeling) (Folds Recognition) (Ab initio Prediction). Æ [1] . Monte Carlo * 2003-9-29, 2004-12-15. 5 (SOM) 563 HP (Simple exact model)[2]. 1.2 HP Dill [2][3] (Two Dimensional Hydrophilic- Hydrophobic Model), 20 (H) (P), H P 1) ( H P ) 2) ( 1). H-H, H-P P-P, H-H −1, 0. i j −1 1) i j (H), |i − j | ≥ 3. 2) i j −1 () H-H G(Z2 , E), Æ Z2 ( Æ), Æ 2 E = ((x, y) , (x , y )) | |x − x | + |y − y | = 1, (x, y), (x , y ) ∈ Z , {H, P} Æ n S

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