毛白杨MSAP体系优化及DNA甲基化的初步分析.pdfVIP

毛白杨MSAP体系优化及DNA甲基化的初步分析.pdf

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第40卷第 12期 东 北 林 业 大 学 学 报 Vo1.40No.12 2012年 l2月 JOURNALOFN0Rm EASrFORESTRYUNIVERSHY Dec.20l2 毛 白杨 MSAP体系优化及 DNA甲基化的初步分析 ) 马开峰 匾 王斯琪 宋跃朋 张德强 (林木育种国家工程实验室(北京林业大学),北京,100083) 摘 要 首次利用MSAP技术开展毛白杨DNA甲基化研究。在优化选择性扩增体系的基础上,对毛 白杨亲 子代的CCGG位点甲基化相对水平、CCGG位点胞嘧啶 甲基化模式的遗传变异进行 了初步分析。结果表 明:① 引 物H/M+3、引物E+^+2、dNTP、 酶、预扩增产物稀释倍数分别为0.03nmol、0.03Illsol、0.20mmol/L、1u(或 1.5 u)、40倍时组成的20 L反应体系经PCR扩增后电泳,可得到品质最佳的银染谱带。②毛白杨CCGG位点甲基化 相对水平约为26.75%~29.39%,CNG甲基化相对水平低于CG甲基化相对水平 ,子代的甲基化相对水平低于亲 本的甲基化相对水平。③子代中发生遗传变异的CCGG位点数之比为 1:1。遗传 自亲本的CG甲基化位点数高 于遗传 自亲本的CNG甲基化位点数,遗传 自父本的甲基化位点数高于遗传 自母本的甲基化位点数;子代甲基化位 点的变异以去甲基化为主,发生CG甲基化变异的位,占’数与发生CNG甲基化变异的位点数之比为 1:l。 关键词 毛 白杨;甲基化敏感扩增多态性(MSAP);DNA甲基化 ;相对水平;遗传变异 分类号 $722.3+4 OptimizationofM SAP System and PreliminaryAnalysisofDNA MethylationinPopulustomentosa/MaKaifeng. ZhangZhiyi,WangSiqi,SongYuepeng,ZhangDeqiang(NationalEngineeringLaboratoryforTreeBreeding,BeijingFor- estry University,Bering100083,P.R.China)//JournalofNortheastForestryUniversity.一2012.40 (12).一1~7 Methylation-SensitiveAmplifiedPolymorphism (MSAP)techniquewasusedfirsdytodetectDNAmethylafioninPop. ulustomentosa.nadtheselectiveamplificationsystemwasoptimized.TherelativelevelofDNA methylafioninCCGG sites 0fP.tomentosa.1,P tomettto$~-2and theiroffspringP×tomentoact.151wasstudied.Also.heredity andvariation of CCGG cytosinemethylationpatternsbetweenparentsandtheiroffspringwereanalyzed.Resultsshowedthebestqualitysil vers~aimngbnadswoIlldbe gotfrom the2O “Lselectiveamplificationsystem,including0.03nmol/LH/M ,primer, O.03nmol/LE+^+2primer,0.2mmoVLdNTP,1U(or1.5U)Taqenzymeand4IxL40timesdilutionofhtepre.amplifi. cationproduct.respectively.Inbothparentsandoffspring.relativelevelof methylatedCCGG was26.75% 一29.39%. TherelativelevelofCNG

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