毛白杨和烟草次生维管发育相关NAC转录因子的比较.pdfVIP

第 5O卷 第 3期 林 业 科 学 Vo1．50．NO．3 2014年 3月 SCIENTIA SILVAE SINICAE Mar．．2014 doi：10．11707／j．1001—7488 毛白杨和烟草次生维管发育相关NAC转录因子的比较术 郭 伟 卢孟柱 (中国林业科学研究院林业研究所 国家林业局林木培育重点实验室 北京 100091) 摘 要： 烟草具有典型的次生维管发育过程，与毛白杨在转录组水平上进行比较，有利于通过烟草来鉴定出次生 维管发育相关的关键基 因。通过高通量测序技术获得烟草维管组织的转录组数据，将 NAC转 录因子基因通过 BLASTP程序 比对毛果杨基因组数据库，共得到43对NAC直系同源基因，并根据序列同源性将其分为 l9个亚组。 利用烟草和毛 白杨 的基 因表达谱 ，分析 NAC基 因表达量变化 ，找到 13对表达模式相似 的烟草和毛 白杨 的同源基 因。选取 8对 NAC同源基 因通过相对荧光定量 PCR进行不同组织的表达分析 ，结果表 明这 8对 NAC同源基 因在 烟草和毛 白杨中的表达模式非常相似。研究结果为利用烟草病毒诱导的基因沉默 (VIGS)技术研究NAC转录因 子 ，进而揭示杨树的维管发育相应基 因的功能提供基础 。 关键词 ： 烟草 ；杨树 ；NAC；维管发育 中图分类号：s718．46 文献标识码 ：A 文章编号：1001—7488(2014)03—0022—09 Comparison ofNAC TranscriptionFactorInvolved inSecondary VascularDevelopmentbetweenPopulustomentosa and Tobacco GuoW ei Lu Mengzhu (KeyLaboratoryofTreeBreedingandCultivationofStateForestryAdministration ResearchlnsituteofForestry，ChineseAcademyofForestry Beijing100091) Abstract： Tobacco(Nicotianatabacum)plantshavetypicalsecondaryvasculardevelopmentprocess．Itisusefulfor identifyingkeygenesin thesecondary vasculardevelopmentbasedon thetranscriptome comparisonbetween tobacco and Populustomentosa．Totally43pairsofNAC orthologousgeneswereidentifiedusingBLASTP search intheentirePopulus trichocarpa genome sequence with NAC transcription factor genes identified in tobacco vascular tissue transcriptome databaseasprobeandwere divided into 19 subgroup basedon thesequencehomology．Theanalysesofgene expression levelsobtainedusingRNA ·seq in tobacco and P．tomentosa suggestthatthereare 13 pairsofNAC orthologousgenes sharingsimilarexpressionpatternsintobacco andP．tomentosa．EightpairsofN