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第一章基因、复制子及基因组
第1节基因概念的发展
经典遗传学关于基因概念的要点:
? 基因是不连续的颗粒状因子,在染色体上有固定的位置,呈直线排列,具有相对稳定性。
? 基因作为功能单位控制有机体的性状表达。
? 基因以整体进行突变,是突变的最小单位。
? 基因是重组的最小单位,在交换中不再分割。
? 基因能自我复制,在有机体内通过有丝分裂有规律地传递
基因的cistron和operon概念
什么是cistron?
在反式构型中,不能发生互补的各个突变型在染色体上所占的一个区域称为一个顺反子。cistron既有功能上的完整性,又有结构上的可分性。
操纵子(operon)概念:
操纵子(operon):指包含结构基因、操纵基因以及调节基因的一些相邻基因组成的DNA片段,其中结构基因的表达受到操纵基因的调控。?正链RNA病毒:病毒的ssRNA可以直接作为mRNA,指令合成外壳及核酸,并组装成病毒体。
?负链RNA病毒:病毒的RNA不能直接作为mRNA。因此,其RNA分子无感染性,需要转录出mRNA才有感染性,但这种转录需要病毒自身的 RNA polymerase ,寄主细胞是不具备的。
?所以,负链RNA病毒都是以完整的病毒颗粒作为感染单位,才能在寄主内正常的复制及繁殖。
重叠基因的定义:
不同的基因共用一段DNA序列,按照不同的阅读框转录,编码一条以上的多肽链。
? 思考题:
1、重叠基因图是通过什么方法做出来的?
2、一条双链DNA片断理论上可以编码多少种氨基酸序列?
端粒(Telomere):线形的染色体末端DNA重复序列与蛋白结合的复合体结构。
扩增:染色体某些区段的DNA序列,其拷贝数专一性地大量增加的现象。
AUD和ADS:
(1)扩增单位,AUD(amplified unit of DNA)指 DNA扩增的区域。AUD长度通常5~25kb,两端是1~2kb的重复序列。
(2)扩增序列,ADS (amplified DNA sequence)指实际扩增的DNA 序列。ADS是由多个AUD串联而成,可从几个到几百个。
真核基因的着丝粒、端粒和复制起点:
着丝粒:着丝粒是DNA上的一段特殊结构,在细胞分裂时提供纺锤丝结合位点。有点着丝粒和区域着丝粒
端粒是真核生物(和某些原核生物)线性染色体两端的特殊DNA与蛋白质的复合体结构。
ARS:酵母的复制起点是指染色体上控制DNA复制起始的一小段 DNA 序列,通常称为 自主复制序列(ARS)。分为A、B、C三个结构域,A、B 2个结构域最重要。结构域A由11个核苷酸组成了保守序列,称为ARS共有序列( ARS consensus sequence),简称ACS。
ORC:6种蛋白以复合体形式存在,称为起始识别复合物,简称ORC (origin recognition complex)。ORC与ARS共有序列ACS结合。 ORC特性类似原核生物DNA复制起始蛋白。
第4节 复制子与细胞周期
细胞周期与复制的2个普通的准则:
? DNA复制的启动,保证了细胞的进一步分裂;
?复制的结束触发了细胞分裂。
复制子(replicon):DNA中发生一次复制的单位称为replicon。噬菌体或病毒DNA也包括一个复制子,但它们在一个感染周期中能引发多次复制。 对于这些原核生物中的特例,定义应该为:含有一个复制起始位点,并且能在细胞中自组复制的DNA分子。
一个细菌复制子需要具有以下几种功能:
? 启动复制过程;
? 控制启动的频率;
? 将已复制的染色体,分配到子细胞中去
真核与原核生物复制的一个明显区别:
真核生物染色体在完全复制好之前,不会再启动新一轮的复制。而原核生物在快速生长
时,起点可以连续发动复制。真核生物在快速生长时,往往采用更多的复制起始点。
A蛋白:噬菌体基因组利用滚环式复制,A蛋白是一种松弛酶(relaxase):具有切割双链DNA能力,并与同时释放出的5`端相结合。A蛋白,是顺式作用蛋白,只同该基因组DNA相结合。但在体外,A蛋白对任何DNA模板都有活性。
每个细菌在复制与细胞生长之间有两个联系:
A. 复制周期启动的频率与细胞生长速度相适应
B. 复制的完成与细胞分裂相关联
复制周期可以根据以下两个常量来定义:
(1)C——复制整个细胞染色体所需的固定时间约40分钟。
(2)D——一个复制周期完成时和细胞分裂之间的固定时间约20分钟。
细胞如何知道什么时间启动复制?
当细胞质量与染色体起始点数目达到一个固定比率时,细胞则启动复制。
细胞质量如何确定?
在整个复制周期中会持续合成启动蛋白质(initiator)该蛋白积累到一定量时就会引发启动。另一种可能是抑制物的负控制,在固定时间内会合成抑制物蛋白质,随着细胞体积增大,抑制物被稀释到低于效应水平,从而引
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