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原核生物基因组结构与功能的特点
1.基因组通常仅由一条环状双链DNA分子组成。
其DNA是与蛋白质结合,但并不形成染色体结构,只是习惯上将之称为染色体。细菌染色体DNA在胞内形成一个致密区域,即类核(nucleoid),类核无核膜将之与胞浆分开。
2.基因组中只有1个复制起点。
3.具有操纵子结构。
操纵子(operon) 是指数个功能相关的结构基因串联在一起,构成信息区,连同其上游的调控区(包括启动和操纵区)及其下游的转录终止信号构成的基因表达单位。
4.结构基因无重叠现象,基因组中任何一段DNA不会用于编码2种蛋白质。
5.基因序列是连续的,无内含子结构。
6.编码区和非编码区(主要是调控序列)在基因组中约各占50%。
7.基因组中的重复序列很少。编码蛋白质结构基因多为单拷贝,但编码rRNA的基因往往是多拷贝的,这有利于核糖体的快速组装。(15AA/秒,2AA/秒)
8.具有编码同功酶的基因(isogene) 这是一类结构不完全相同,而功能相同的基因。如E.coli含有2个编码乙酸乳酸合成酶的基因和2个编码分支酸变位酶同工酶的基因。
9.细菌基因组中存在可移动的DNA序列,包括插入序列和转座子。
10.原核基因的基本结构特点:
启动子(promoter)、操纵基因(operator)、调控序列、结构基因(structure gene)、终止子(terminator)。
真核基因的基本结构
1.结构基因、内含子和外显子、断裂基因。
(1)结构基因(structural gene)指能转录成为mRNA、rRNA或tRNA的DNA序列。
(2)内含子和外显子 真核生物的结构基因是不连续的,编码序列被非编码序列打断,在编码序列之间的序列称为内含子(intron),编码序列称为外显子(extron)。
(3)断裂基因(split gene) 在真核的结构基因组中,编码顺序被许多称为内含子的非编码区分割成几段称之。
病毒基因组
基因组(genome) 1个配子(精子或卵子),1个单倍体细胞或1个病毒所包含的全套基因。病毒核酸或为DNA或为RNA,可以统称为病毒染色体。
完整的病毒颗粒具有蛋白质外壳,以保护病毒核酸不受核酸酶的破坏,并能识别和侵袭特定的宿主。类病毒例外,它是一类植物病毒,为很小的单链闭环RNA(250-400碱基)。
病毒核酸与所有的原、真核生物的核酸组比较,最为突出的特点是每种病毒颗粒只含1种核酸,或DNA或RNA,两者不共存于1种病毒颗粒中,据此,病毒可以分成两组,即DNA病毒和RNA病毒。
病毒核酸分子量大小:RNA病毒小106-107D,DNA病毒大;107-108D
基因数:3-几百个
病毒基因组结构功能特点
(一)病毒核酸可以是ssDNA、dsDNA或RNA分子,分子结构有发夹、环状、线型、节段型。以SSDNA,dsRNA最为突出。
(二)基因重叠 即同一段基因可以编码2种或以上的基因产物这种现象在其它生物细胞仅见于线粒体和质粒DNA.所以是病毒核酸较为独特结构,能使小小病毒携带较多的遗传信息,原因是病毒基因阅读框可以错位(SV40)。
(三)连续的和不连续的基因 病毒基因结构特征往往与其宿主细胞基因结构相似。
原核病毒(如噬菌体)基因是连续的,没有内含子;
真核病毒(如多瘤病毒)基因是不连续的,有内含子。
有意思的是,有些真核病毒的内含子或其中的一部分对某一基因来说是内含子,对另一基因却是外显子。
如SV40和多瘤病毒的早期区域就是这样的。
除了(+)RNA病毒外,真核病毒基因都是先转录成mRNA前体,再经过剪接等步骤能成为成熟的mRNA.
(四)节段性基因 大部分病毒核酸都是由一条双链或单链构成,少数病毒核酸由数个片段构成。这类病毒一般是RNA病毒。如flu-v由6-7个片段构成,各段在天然状态下不连接,而且可以转录成6-7个片段相应的 mRNA。单独的片段没有感染性,要一起感染才发挥作用。
(五)除了retro-v外,所有的病毒基因都是单倍体基因。即每个基因在某个病毒颗粒中只出现一次,即只有1套基因。
(六)编码区非编码区(95%/5%)。病毒核酸大多数顺序都用来编码蛋白质。
(七)基因常常成簇排列,没有间隔序列或间隔序列很小。功能相关蛋白质基因在基因组的1个或几个特定部位,丛集成簇被转录成多顺反子,然后加工成各种蛋白质的mRNA模板。如腺病毒晚期基因。
(八)不规则的结构基因
1.几个结构基因的编码区不规则,因此有些结构基因无翻译起始序列。
2.有的mRNA(=gene)没有5’帽子,但有翻译增强子。
(九)DNA或RNA 1种病毒基因组只有1种核酸。
乳糖操纵子调节机制
色氨酸操纵子的调
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