四个DNA片段在山茶属分子系统学研究中的应用.pdfVIP

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2017-09-03 发布于重庆
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四个DNA片段在山茶属分子系统学研究中的应用.pdf

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云南植物研究 2006 , 28 (2 ) : 108 ～114 Acta Botanica Yunnanica 四个 DNA 片段在山茶属分子系统学研究中的应用  1, 2 1 1 1 1 杨俊波 , 李洪涛 , 杨世雄 , 李德铢 , 杨莹燕 ( 1 中国科学院昆明植物研究所生物多样性与生物地理学重点实验室 , 云南昆明 6502 04 ; 2 中国科学院研究生院, 北京 100039 ) 摘要 : 选取山茶属 14 个组中的 10 组 2 1 种植物对目前常用于属内种间的 4 个 DNA 片段 ( ITS、waxy 、 trnL- F、rpL 16) 进行序列测定。结果表明: ( 1) 来自叶绿体基因组的 2 个片段 ( trnL-F 、rpL 16 ) 其 PCR 扩增和测序都很容易, 但两者的进化速率都非常慢 , 序列矩阵只有很少信息位点 ( trnL-F 含 9 个 , rpL 16 为 20 个) , 不能提供必要的系统发育信息。(2 ) 来自核基因组的 ITS 片段其 PCR 产物比较容易获得 , 但其序列的测定存在较多问题。( 3) waxy 是来自核基因组的另一个片段 , 其 PCR 扩增因受模板 DNA 的数量和质量的影响很大而有一定难度 , 但其进化速率较快 , 序列矩阵具有较多信息位点 (92 个) , 并且在山茶属是单拷贝, 这对于解决山茶属这类具有许多近缘物种的类群的系统关系有重要价值。基于 tsnL-F、 rpL 16 和 waxy 三组数据所建分子系统树支持山茶属为一单系 , 但属下系统由于取样等原因有待进一步研究。关键词 : 山茶属 ; DNA 序列 ; 进化速率 ; 分子系统学中图分类号 : Q 946 , Q 949 文献标识码 : A 文章编号 : 0253 - 2700 (2006 ) 02 - 108 - 07 The Application of Four DNA Sequences to Studying Molecular * Phylogeny of Camellia ( Theaceae) 1 , 2 1 1