聚乙烯唑啉作用下甲烷水合物分解的分子动力学模拟 Molecular Dynamics Simulation of CH4 Hydrate Decomposition in the Presence of Poly(2-ethyl-2-oxazoline).pdfVIP

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2017-09-03 发布于湖北
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聚乙烯唑啉作用下甲烷水合物分解的分子动力学模拟 Molecular Dynamics Simulation of CH4 Hydrate Decomposition in the Presence of Poly(2-ethyl-2-oxazoline).pdf

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物理化学学报(Wuli Huaxue Xuebao) 1676 Acta Phys. -Chim. Sin . 2012, 28 (7), 1676-1682 July [Article] doi: 10.3866/PKU.WHXB201205041 π堆积的腺嘌呤-胸腺嘧啶体系激发态电荷转移和无辐射失活的半经典动力学模拟张文英马静袁帅* 舒坤贤豆育升 (重庆邮电大学生物信息研究所, 重庆400065) 摘要: 采用半经典电子-辐射-离子动力学(SERID)模型模拟了π堆积的腺嘌呤-胸腺嘧啶(A-T)体系激发态的光 + - * 物理失活过程. 设置激光脉冲仅作用于T, 模拟发现电子由A 转移到T, 形成(A T ) 激基缔合物(exciplex). 当分子间距缩短至0.300 nm 时, 由于轨道离域效应产生电荷重组, 体系恢复电中性; 当A 分子的C4ʹ－C5ʹ扭曲程度最大时, 体系通过避免交叉点衰减至基态. Exciplex 的失活途径由分子间距离和A 分子的变形程序两个因素决 * 定. 由于A 分子的C4ʹ、C5ʹ原子位阻较大, 难以达到失活所必需的强烈扭曲, 因此(A-T) 的寿命比胸腺嘧啶堆积 * 体系(T-T) 显著增长. 关键词: DNA碱基; 堆积效应; 激基缔合物; 电荷转移; 无辐射失活中图分类号: O644; O641 A Semiclassical Dynamics Simulation on Charge Transfer and Radiationless Deactivation Excited State of π-Stacked Adenine-Thymine System ZHANG Wen-Ying MA Jing YUAN Shuai* SHU Kun-Xian DOU Yu-Sheng (Institute of Bio-information, Chongqing University of Posts and Telecommunications, Chongqing 400065, P. R. China) Abstract: A semiclassical electronic radiation ion dynamics (SERID) simulation was used to study the photophysical deactivation of π-stacked adenine and thymine. A laser was only applied to the thymine + -