病毒命名与分类系统的研究进展.docVIP

病毒命名与分类系统研究进展 徐耀先　解梦霞　向近敏 　　关键词　病毒分类，命名，单分子负链RNA病毒目，套病毒目，有尾噬菌体目 Research Advances on the International Rule of Virus Nomenclatureand the Universal System of Virus Taxonomy Xu Yaoxian1 Xie Mengxia1 Xiang Jinmin21 (Department of Biology, Hubei Medical University, Wuhan 430071)2 (Institute of Virology, Hubei Medical University, Wuhan 430071) 　　Key words Virus taxonomy, Nomenclature, Mononegavirales, Nidovirales，Caudovirales 　　病毒的命名过去不够统一，有些病毒是以宿主、病理特点、致病症状、病毒颗粒形态进行命名，有些病毒是以地名和人名进行命名，还有些病毒是以字母和数字命名。病毒的分类系统也不一致，动物病毒分类等级设立科、属、种；而植物病毒分为组、亚组、种。为了力求分类和命名的统一，1992年Martelli首先提出了植物病毒的科、属、种分类原则，1993年8月在英国格拉斯哥召开的第9届国际病毒大会上，国际病毒分类委员会(ICTV)采纳了这一分类原则，并且新设立了一些植物病毒的科、属［1］，1995年在ICTV所公布的病毒分类和命名第六次报告中，植物病毒分类已不再采用组、亚组，而统一使用科、属、种分类系统［2］。病毒的分类系统也开始逐渐向更高级的分类等级发展，1991年ICTV在病毒分类和命名第五次报告中首次公布了比科更为高级的分类等级，单分子负链RNA病毒目(Mononegavirales)［3］，最近ICTV又先后增设了套病毒目(Nidovirales)［4］和有尾噬菌体目(Caudovirales)［5］。除此以外，1996年8月ICTV在第10届国际病毒大会上还对原有的病毒分类和命名规则作了进一步的修订，提出了38条新的病毒命名规则［6］。最近据Mayo等报道，ICTV又批准了43条新的病毒分类和命名规则，同时对病毒目、科、属和种名的书写也作了专门的规范［7］。 1　病毒命名规则　　国际病毒分类系统采用目(order)、科(family)、属(genus)、种(species)，但不是所有的病毒科都必须隶属一个目，在没有适当目的情况下，科可以是最高的病毒分类等级，在科下面允许设立不同的亚科或不设立亚科，病毒分类和命名不遵守优先法则，所用的命名应该便于使用和记忆，在设立新分类等级时，不能使用人名命名，上标和下标字符、连字符、斜线、希腊字母在新命名中不能使用，如果缩拼字对这一领域的病毒学研究工作者是有意义的，而且经过几个国际病毒研究小组建议，那么缩拼字命名是可以接受的。现有的病毒分类名称只要是有用的就应保留，新的命名不能与已经承认的病毒名称重复。人工产生的病毒和实验室的杂种病毒在分类学上不予考虑。1.1　病毒种的定义和命名　病毒“种”是指构成一个复制谱系(replicating lineage)、占据一个特定小生境(ecological niche)、具有多个分类特征的病毒。这就是说病毒种的分类和命名不是单纯由某一个分类特征、而是由多原则分类特征决定的，包括病毒的基因组组成，病毒颗粒形态结构、生理生化特性和血清学性质等；而病毒种的一个复制谱系则强调了病毒种的系统进化特性，即现今所有的病毒种可能起源于共同的病毒祖先；病毒种所占有的小生境是指某种病毒的特定生物学特性、地理分布、宿主范围、媒介的嗜亲性、致病机理等［8］。　　病毒种的命名由几个有实际意义的词组成，但不是单独以宿主名加“virus”构成，当ICTV下属委员会不能肯定一个新的病毒种的分类地位时，新的病毒种可以作为暂定种列在适宜的属和科中；在不考虑病毒属和科的情况下，病毒种名与病毒株一起，均应有明确的含义；如果数字和字母已经用于某一特定病毒种的命名，其数字、字母或其组合可作为病毒种的形容词，现在已知的细菌病毒种名就是由数字和字母组成的，这些细菌病毒通常没有太大的表型上的差异，而且感染相同或相似的宿主；植物病毒种的命名，一般是由宿主名加症状名和“virus”构成。1.2　病毒属的命名　病毒属是一群具有某些共同特征的种。其属名的词尾为“virus”，但在设立一个新的病毒属时必需有一个同时被承认的代表种(type species)。1.3　病毒科的命名　病毒科是一群具有某些共同特征的属。科名的词尾为“viridae”，“科”下面可以设立或不设立亚