几种新型DNA分子标记及其在食用菌的研究中的应用54998.pdfVIP

维普资讯 食 用菌学报 2006．13(1)：78~81 文章编号 ：1005—9873(2006)01—0078—04 几种新型DNA分子标记及其在食用茵研究中的应用 边银丙，宋小亚 (华中农业大学应用真菌研究所 ，武汉 430070) 摘 要 ：综述 了新型分子标记 SCAR、ISSR、SRAP和 TRAP的原理与特点，以及这些技术在食用菌研究中 的应用现状和前景 。 关键词 ：食用菌；SCAR；ISSR；SRAP；TRAP 中图分类号 ：S646．01 文献标识码 ：A 与形态学标记 、细胞学标记和生化标记等相 接分析 ，一般是对 RAPD或 AFLP标记进行克 比，分子标记 以其显著 的优势广泛应用于动植物 隆、测序后转换为SCAR标记 。由于 RAPD扩增 遗传育种、连锁图谱构建、基因定位与克隆、物种 过程 中碱基并非严格匹配，错配率较高，且一般 鉴定、居群遗传学与系统进化发育等诸多方面。 RAPD标记片段同源性较高，从而导致 SCAR标 目前 已开发 出数十种分子标记，其 中以RFLP、 记的转换成功率较低 [6]。 RAPD和 rDNA在食用菌 中应用 的研究报道居 LOFTUSMG等应用 SCAR标记进行 了褐 多。分子标记在食用菌中的应用起步较晚，如何 色蘑 菇 (Agaricusbisporus)育 种研 究，对经 在食用菌研究中引进新型分子标记 ，已成为食用 RAPD扩增获得 的特异性条带进行克隆和测序 ， 菌研究工作者面临的重要课题 。 根据测序结果设计 1对 PCR引物，在所有供试菌 株中均扩增 出相 同大小 的条带[7]。吴学谦等采 1 SCAR (SequenceCharacterizedAmplified 用 RAPD分析从香菇 (Lentinulaedodes)菌株 Region，特征性片段扩增区域) _ 162和申香 10号中各获得了 1条特异性片段 ，进 1993年 ，PARAN I和 MICHELMORERW 一 步转化为稳定的SCAR标记 ，作为香菇 162和 在 RAPD标记基础上提 出了SCAR标记口]。该 申香 10号菌株的特异 DNA指纹 ，应用于菌株鉴 标记 以特异 RAPD片段序列为基础 ，根据两端序 定 ]。在食用菌研究中，如果能获得各个菌株 的 列设计 1对 18~24个碱基的引物 ，在较高的退火 特异 SCAR标记，不仅能对种质资源的遗传多样 温度下进行特异性扩增，实现 由RAPD标记到 性进行系统地分析评估 ，为食用菌种质资源保 SCAR标记 的转化。它直接采用专一性特异引 护、种群分类和栽培菌株鉴定提供依据 ，而且可 物进行 PCR扩增 ，排除了随机引物结合位点之间 以从分子水平上进行伪劣菌种辨别 。谢宝贵等 的竞争，且避免 了筛选引物 、估算样 品间遗传相 结合群体分离分析法进行 了 白色金针菇的分子 似性和聚类分析等繁琐过程 ，使稳定性和重复性 标记辅助育种 ，从 200个随机引物 中筛选 出与金 得 以显著提高。SCAR标记一般表现为扩增片 针菇子实体白色基因连锁的特异片段 $375，并成 断的有无，适合于大量个体 的快速检测 ，便捷可 功地转化为 SCAR标记 ，PCR产物不需 电泳，加 靠 ；目前 SCAR标记 已被广泛应用于许多重要农 EB后可在紫外灯下直接检测[9]。 林经济作物的种质鉴定、分子标记辅助育种、遗 2 ISSR (Inter—SimpleSequenceRepeat， 传连锁图谱构建和基因定位等方面研究[2]。 简单重复序列间扩增) SCAR标记是