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2011-07
承担单位:福建省农科院农业生物资源研究所
试验设计:
试验项目:芽孢杆菌和大肠杆菌质粒标准品的制备
试验人员:刘云浩
试验负责:蓝江林
报告日期:2011年07月
计数月份:2011年07月
研究资格系数
(0.5-1.0)
实验设计系数
(0.9-1.0)
报告得分
总分
实验设计
实验记载
实验分析
实验简报
实验文章
1-20%
21-40%
41-60%
61-80%
81-100%
1%-5%
设计不足,实施错误
6%-10%
设计不全,实验无果
11%-15%
设计可以,实施不全
16%-20%
设计完整,分布实施
21%-25%
实验不全,记载无果
26%-30%
实验不足,记载不全
31%-35%
独立实验,记载不全
36%-40%
分布实验,记载完整
41%-45%
目的明确,实验完成
46%-50%
实验完整,记载清晰
51%-55%
实验系统,结果可信
56%-60%
实验创新,分析清晰
61%-65%
实验创新,结论清晰
66%-70%
实验完整,统计清晰
71%-75%
实验系统,数据可靠
76%-80%
报告完整,文章雏形
81%-85%
结构合理,分析有据
86%-90%
逻辑清晰,统计合理
91%-95%
图表完整,写作流畅
96%-100%
文献完整,发表水平
福建省农业科学院农业生物资源研究所
农业微生物研究中心
电话: 0591 传真: 0591 HYPERLINK / fjat HYPERLINK / .
1.试验目的
鉴于之前提取的芽孢杆菌和大肠杆菌的质粒都有RNA的污染,本试验采用天根生物的质粒提取试剂盒来提取重组质粒,以求获得纯度很高的质粒,为下一步质粒标准品的获取奠定基础。
2.试验方法
2.1 材料和试剂
2.1.1材料
TIANprep MiNi Plasmid Kit(天根生物)。
2.1.2试剂和仪器
无水乙醇,去离子水,电泳仪,核酸蛋白定量仪。
2.2 方法
2.2.1 质粒提取步骤
1. 柱平衡步骤:向吸附柱CP3中(吸附柱放入收集管中)加入500μl的平衡液BL,12,000
rpm (~13,400×g ) 离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中(请使用当天处理过的柱子)。
2. 取1-5 ml过夜培养的菌液,加入离心管中,使用常规台式离心机,12,000 rpm (~13,400×g ) 离心1分钟,尽量吸除上清(菌液较多时可以通过多次离心将菌体沉淀收集到一个离心管中)。
3. 向留有菌体沉淀的离心管中加入250 μl溶液P1(请先检查是否已加入RNaseA),使用移液器或涡旋振荡器彻底悬浮细菌沉淀。注意:如果有未彻底混匀的菌块,会影响裂解,导致提取量和纯度偏低。
4. 向离心管中加入250 μl溶液P2,温和地上下翻转6-8次使菌体充分裂解。注意:温和地混合,不要剧烈震荡,以免打断基因组DNA,造成提取的质粒中混有基因组DNA片断。此时菌液应变得清亮粘稠,所用时间不应超过5分钟,以免质粒受到破坏。如果未变得清亮,可能由于菌体过多,裂解不彻底,应减少菌体量。
5. 向离心管中加入350 μl溶液P3,立即温和地上下翻转6-8次,充分混匀,此时将出现白色絮状沉淀。12,000 rpm (~13,400×g )离心10分钟,此时在离心管底部形成沉淀。注意:P3加入后应立即混合,避免产生局部沉淀。如果上清中还有微小白色沉淀,可再次离心后取上清。
6. 将上一步收集的上清液用移液器转移到吸附柱CP3中(吸附柱放入收集管中),注意尽量不要吸出沉淀。12,000 rpm (~13,400×g)离心30-60秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CP3放入收集管中。
7. 可选步骤:向吸附柱CP3中加入500 μl去蛋白液PD,12,000 rpm (~13,400×g )离心30-60秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CP3重新放回收集管中。如果宿主菌是end A +宿主菌(TG1,BL21, HB101,JM系列, ET12567等),这些宿主菌含有大量的核酸酶,易降解质粒DNA,推荐采用此步。如果宿主菌是endA -宿主菌(DH5α,TOP10等),这步可省略。
8. 向吸附柱CP3中加入600 ul漂洗液PW(请先检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm离心30~60秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CP3放入收集管中。
9. 重复操作步骤8。
10. 将吸附柱CP3放入收集管中,12,000 rpm离心2分钟,目的是将吸附柱中残余的漂洗液去
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