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利用微卫星标记分析8个亚洲水牛群体遗传结构
研究生:王冬蕾
导师:常洪教授
(扬州大学动物科学与技术学院)
摘要
.多重PCR技术,对6个中国地方水牛品种(德昌水牛、兴隆水牛,富钟水牛、
温卅I水牛、东流水牛、福安水牛)和2个引进水牛品种(摩拉水牛、尼里一拉菲
水牛)进行遗传结构分析。通过计算遗传杂合度、多态信息含量、奈氏遗传距离
和奈氏标准遗传距离,采用邻近结合法和非加权组对算术平均法进行聚类分析和
群体遗传结构分析了8个亚洲水牛群体内和群体间的遗传变异,结果如下:
8个水牛群体在13个微卫星座位中共检测到157个等位基因,其中7个群体
具有各自的特有等位基因,其和为23;该8个群体在13个微卫星座位的等位基
0.4951.0.7194之间,多态信息含量在0.4495--0.6776之间。
体杂合度;基因分化系数平均为O.1424。在总变异中,有14.24%的变异来自群体
间。
其余11个座位为高度多态座位,是适合分析水牛遗传多样性的多态标记;
2个引进水牛品种与6个国内水牛群体之间的遗传距离较远。国内群体中,
牛距离最远,东流水牛与富钟水牛距离最近。
聚类分析表明8个亚洲水牛群体聚为3大类,第一大类有:富钟水牛、东流
水牛、兴隆水牛、温州水牛和福安水牛;第二大类德昌水牛独自聚为一类;第三
大类:两个引进品种聚为一类。
关键词:水牛;微卫星;遗传多样性;多重PCR;荧光引物
on
the structureof buffalo
Analysisgenetic eight
inAsia microsatellitemarkers
populations
using
M.S.Candidate:WangDonglei
Advisor:Prof.ChangHong
The structure 6Chinesenative
genetic among buffalo
to2introducedbuffalo
Xinglong、Fuzhong、Wenzhou、Dongliu、Fu’an)incomparison
13microsatelliteDNAmarkers
breeds(Murrah、Nili-Ravi)WaSanalyzedusing
recommendedFAOandISAGand PCRbasedon
by fluorescence—Mutiplex
ABl3100-Avant.The information
genetic
distance these were andthese8
content(Pie),genetic
amongpopulationscomputed
buffalo were structure
populationsclustered,principalcomponent
analysis,population
wereusetoevaluatethe
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