真菌蛋白质组学的研究——方法与进展.pdfVIP

第12卷第8期 中国食品学报 、 V01．12No．8 of ofFood and O1 2 20 1 2年8月 JoumalchineseInstitute science Technobgy Aug．2 真菌的蛋白质组学研究——方法与进展 顾丰颖 高 洁 阮 晖 何国庆’ (浙江大学生物系统工程与食品科学学院 杭州310058) 摘要蛋白质组学分析作为对生物体代谢调控分析非常有效的技术手段，在近年来被广泛应用在微生物代谢 调控研究中。真菌是与人们生产、生活密切相关的一类非常重要的微生物，弄清其代谢调控机制，可为日后的生 产应用奠定理论基础。本文就近年来应用在真菌蛋白质组学上的研究方法以及研究进展作一综述。 关键词蛋白质组学；真菌；胞内蛋白质组学；分泌组；亚蛋白质组学 文章编号 1009—7848(2012)08—0135—06 真菌具有高效的表达和分泌系统，在工业生 增了大量基础研究数据。大量的真菌基因组序列 产中广泛应用【l】。随着对其了解的深入，许多真菌， 被分析并公布其结果，蛋白质组学的研究技术得 例如黑曲霉(A印e哂Zbn谚r)等已作为“细胞工 到快速的发展。 厂”得到学者们的关注。真菌在人类的生产、生活 微生物的蛋白质组学研究目前主要有3种策 中一直扮演着重要的角色．在食品、有机酸、药品、 略：一是表达蛋白质组学，即采用蛋白质组研究技 酶剂的生产以及农业的生物防治等白色生物技术 术尽可能全面地分析微生物分泌表达的蛋白质组 方面发挥着重要的作用。 分，建立蛋白质组表达谱及其蛋白质数据库；二是 1个细胞内的基因、转录本及蛋白质之间的 比较蛋白质组学．即采用蛋白质组学技术对不同 相互作用网络决定了细胞内在复杂性。只有对蛋 生理特性的菌株进行比较，分析同一组分蛋白质 白质这个生物体的执行者及最终表现形式深入了 在不同阶段的表达数量、表达水平和修饰状态的 解之后，才可能弄清细胞的结构、生物学特性以及 差异。发现相关的特异性蛋白质；三是免疫蛋白质 病理过程，从而更好地掌握整体有机体的微生物 组学。即采用免疫学与蛋白质组学相结合的方法 寻找特异性相关抗原。 学(whole—organismmicrobiolog)r)。与其它原核微 生物相比。真菌的生长代谢及蛋白质分泌系统更 大多数的蛋白质组分析需要建立在高分辨率 为复杂。对真菌代谢调控的研究不应局限于针对 及高通量的质谱(Mass 某些“关键”蛋白质的研究。欲从系统上阐明生命 上。目前，对蛋白谱的分析常用的技术路线有3 活动机制，必须掌握蛋白质表达的全局。随着后基 条：双向电泳一质谱(2D—PAGE—MS)、色谱一质谱及 因组时代的到来，蛋白质组学逐渐被应用于更广 毛细管电泳一质谱(CE—MS)分析。双向电泳技术作 泛的科学研究领域中。本文总结真菌蛋白质组的 为最常用的蛋白质组学分析技术，可对pI3～10， 研究策略、技术以及近年来真菌蛋白质组的研究 分子质量为10～200ku的蛋白进行较好地分离。 成果。 但该技术容易受外界环境的干扰，对一些特殊性 质的蛋白质(分子质量过大的蛋白，极端酸性或碱 1 真菌蛋白质组学研究策略及技术 性的蛋白，疏水膜蛋白