自适应模糊偏最小二乘方法在药物构效关系建模中应用.pdfVIP

自适应模糊偏最小二乘方法在药物构效关系建模中应用.pdf

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第33 卷 分析化学 (FENXI HUAXUE ) 研究简报 第7 期 2005 年7 月 Chinese JournaI of AnaIyticaI Chemistry 972 ~ 976 自适应模糊偏最小二乘方法在药物构效关系建模中的应用 * 成 忠 陈德钊 吴晓华 叶子青 (浙江大学化学工程系仿真中心,杭州3l0027 ) 摘 要 作为一种局部逼近方法,自适应神经模糊推理系统(ANFIS )适于为药物定量构效关系(OSAR )建模。 描述药物分子结构的参数较多,常存在耦合关系,会增加建模难度,并影响模型的预报性能。为此,将ANFIS 和偏最小二乘(PLS )相结合,先由PLS 从样本数据中提取成分,再由ANFIS 实现每对成分间的非线性映射,并 基于输出误差进一步修正所提取的成分,使之对因变量具有最优的解释能力,由此构建为EB-AFPLS 方法。 该法已成功地应用于HIV-l 蛋白酶抑制剂的OSAR 建模,效果良好,显示出很强的学习能力,所建模型的预报 性能也优于其它方法。 关键词 非线性偏最小二乘,模糊推理系统,神经网络,药物定量药效关系,HIV-l 蛋白酶抑制剂 1 引 言 [l,2 ] 药物定量构效关系(guantitative structure-activity reIationship ,OSAR )多为非线性的 ,常用实验测 定的和理论计算的参数表示分子结构,局部效应显著,然而随着参数增多,会存在复共线性,将影响建模 的稳定性。可用非线性偏最小二乘(non-Iinear partiaI Ieast sguares ,NLPLS )方法,从自变量、因变量中成 对地提取最优成分,消除复共线性,再令成对成分进行非线性逼近[3 ~ 5 ]。多项式和多层前传网(muIti- Iayer feedforward network ,MLFN )均为全局逼近,且低次多项式逼近精度有限,高次的会引起振荡,MLFN 则易造成过拟合或欠拟合。 [6 ,7 ] 基于模糊逻辑的模糊推理系统,能以任意精度逼近非线性函数 ,此为局部逼近,拟合良好,预报 [8 ] 精度较高 。本研究拟将基于自适应神经模糊推理系统(adaptive neuro-fuzzy inference system ,ANFIS ) 用于成对成分的非线性逼近,并通过误差修正与PLS 方法相关联,构成基于误差修正的自适应模糊偏 最小二乘( error-based adaptive fuzzy PLS ,EB-AFPLS )算法。将它应用于人类免疫缺陷病毒l 型(HIV- [9 ] l )蛋白酶抑制剂 的OSAR 建模,效果良好。 2 ANFIS 自适应模糊推理系统 T [l0 ] 以! = (x l ,x2 ,…,xp )为p 维输入向量,y

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