三锭DNA结构的研究新进展.pdfVIP

维普资讯 ；7一 7 [JI 动 物 学 研 究 1997，18 (4)：4374 46 cN 5} 1040／Q ISSN 0254—5853 Zool~lgicalResearch p ～ ’-～ ：综 述 ： ～ · - 三链 DNA结构研究的新进展 杨林静 型 全 白春礼 ‘中国科学皖化学研究所 北京 100080) 董2 中国科学院比明动物研究所细胞与分于进化开放研究实验室 昆明 650223) f 摘要 本文 羊细总结丁近年束三螺旋DNA的结构和应用研究方面的进展，分析了各种因素 c例如DH 抗衡离子、温度等)对 螺旋稳定性的影响，井提出丁一些在三螺旋DNA中富有挑 战性的需翮进步研究的问题。 关键词 三链DNA，结构，进展 _ _ _ — 一 ● 。一 矸獬 1 历史回顾 l953年，Watson—Crick提出了DNA双螺旋的结构模型，揭开了人类在分子水平上 认识生命现象的新篇章，并由此奠定了分子生物学及分子遗传学的基础。随着 DNA结构 和功能研究的迅速发展，人们发现DNA结构不仅是双螺旋形式，而且还有其它多种存在 形式。1957年，Felsenfeld等首次提出了三链核酸的概念，并且在含二价金属离子 的溶液 中合成 rpoly(rU)·poly(rA)·poly(rU)RNA三螺旋。Morgan等 (1968)在体外实验 中发 现三链复合物能够抑制 RNA 中间体聚合酶的转录作用 Arnott等(1974)在研究 A【) · 2(I)和 (A) ·2(T)等三螺旋 的x一射线纤维衍射 的基础上，建立 了三链 DNA结构模型。 8O年代初，人们发现在几种真核基因的上游区，单链特定区域有 s 内切酶的敏感位点 (Larsen等，1982)，这些位点对应到(R)。(Y)序列上，通过亚克隆进入超螺旋质粒，表现 出对 s酶相同的敏感性 (wells等，1988；Htun等，1989)。随后，这种敏感性被确认为 是在单链区双螺旋向分子内三螺旋转化过程中产生的。这个发现激起了人们研究三链核酸 的极大兴趣。Moser等 (I987)证明一个寡聚棱苷酸可以结合到双螺旋的大沟上，从而形成 分子删三螺旋。同时，Hel~ne及其同事也报道了 一寡聚核苷酸和DNA双螺旋形成三链 复合物。这些研究结果表明，DNA双螺旋对特定序列识别的新战略在基因学、生物化 学、遗传学和医药学等领域有广泛的应用前景。本文将着重讨论近几年三链核酸研究的进 展，有关 1992年以前的综述见 白春礼等(1993)的评述。 2 结构类型的定义厦分类 现在所沿用的核酸三螺旋的定义基本上是 Felsenfeld(1957)所提出的。根据第 3条 奉文 1996年 6月26日收到一1997年 6H 16I=1修 维普资讯 动 物 学 研 究 8卷 核苷酸链是以 Hoogsteen还是反 Hoogsteen氧键配对方式结合到双螺旋上可产生至少两 种三螺旋的结构类型：“嘧啶型”和 “嘌呤型”。 2．1 “嘧啶型”三螺旋 DNA “嘧 啶型 ”或嘧啶 嘌岭 嘧 啶 (Y ·RY)型 三螺旋 中，第 3条 嘧啶链 以平行于 Watson—Crick双螺旋中嘌呤链的方 向，缠绕到双螺旋的大淘上，专一性地与嘌呤链结 合。例如典型的 Y ·RY型三螺旋 T ·AT和C ·GC(Riley等，1966；Lee等，1979)， 其专一性体现在 T对 AT，质子化的 c对 Gc的识别。这些三螺旋的结构基本单位是三 碱基体L图 1)。T ·AT和 c一·Gc三螺旋的链 3和链 2的碱基间以两个 Hoogsteen氢键 配对，不影响链 1和链 2问的相互作用。