6个地方鸡种线粒体COI基因的DNA条形码研究.pdfVIP

第一篇遗传育种 6个地方鸡种线粒体COI基因的DNA条形码研究。 高玉时，屠云洁，童海兵，王克华，唐修君，陈宽维，顾 荣 (中国农业科学院家禽研究所，江苏扬州 225003) 摘 要：以我国6个地方鸡种为研究对象，利用DNA测序技术测定了线粒体细胞色素C fo)【idase 氧化酶I(cytochromeI，00工)基因的两段序列，探讨00工这一特定基因的 特定区段作为DNA条形码在识别地方鸡种方面的可行性和有效性。研究结果表明：所选 择的两段序列中，经过多态性分析筛选，以Barl序列(712位到1359位)突变位点较 多，为24个，品种间平均多态性为3．860％，6个鸡种均有其特异位点，6个品种的 DNA分类和形态学分类基本一致，该00工基因的Barl序列用于这些品种鉴定是可行的。 从本研究结果看，利用C0工基因的DNA条形编码(DNABarcodes)进行不同鸡品种鉴 定具有方便、快捷、经济、准确等优点，结合传统形态学鉴定手段将会揭示更深层次的遗 传多样性和系统进化关系，经过进一步改进是用于品种鉴定的优良工具。 关键词：地方鸡种；鉴定；∞工基因；DNA条形码 由于我国家禽品种市场还欠规范，培育的品种良莠不齐，假冒伪劣、以次充好的现象时有发 生，加之目前鉴定家禽品种主要是通过鸡种形态学标记分析和生产性能测定等手段，由于鉴定周期 长、受环境影响大，准确性、科学性欠缺，导致了一些品种的知识产权和育种者的权益得不到很好 的保护。快速准确地鉴定品种对于鸡品种质量标准化、新品种审定、假冒伪劣品种鉴别、解决产权 M以n￡．，2006)。 纠纷均有重要作用(Hajibabaei Paul co妇daseI， Hebert等于2003年提出利用线粒体细胞色素C氧化酶I(cytochrome 00工)这一特定基因的特定区段来做DNA条形编码的基础，期待给所有生物种进行编码(Hebert 以口z．，2003a，2003b)。DNA条形编码(DNABarcodes)目前被推荐为一个行之有效的生物鉴定 手段，它将对保护生物学，生物多样性研究的发展起着至关重要的作用。其主要作用包括可以完成 物种的区别和鉴定，发现新种和隐存种，重建物种和高级阶元的演化关系。它将完成一些传统形态 学鉴定手段无法完成的工作(肖金花等，2004)。∞工基因中部分片段能够用作条形编码的基因， 是因为∞工在能够保证足够变异的同时又很容易被通用引物扩增，而且目前研究表明，其DNA序 列本身很少存在插入和缺失(即使有少数也主要分布于该基因的3’端)，对结果的分析不会造成很 大的影响。同时，它还拥有蛋白编码基因所共有的特征，即密码子第三位碱基不受自然选择压力的 E．M以以．，2004)。 影响，可以自由变异(Brooks 果表明：每种鸟都有一个单独的条形编码。Kress(2005)研究发现利用∞工基因可对97．9％的 o．43％，而品种间的变异平均为3．887％。在国内，许多科学家也做过类似的研究，Gao等 (2003)通过分析中国对虾的∞工部分基因，认为该基因在中国对虾中非常保守，有助于种间进 化关系的研究；董云伟等(2004)对轮虫oo工部分基因测序，分析其基因序列变异及种群遗传结 作者简介：高玉时，副研究员，主要从事动物遗传育种研究。E-mail：gaoysloo@sim．corIl。 391 中国家禽业——机遇与挑战 罗氏沼虾线粒∞工基因的遗传多样性；潘程莹等(2006)测定了Co工基因序列，探讨Co工基因 作为DNA条形码在识别蝗虫物种方面的可行性。 目前国际上主要利用oD工部分基因作为DNA条形码对无脊椎动物鉴定进行了研究；国内类 似的研究也主要为无脊椎动物，将线粒体基因组∞工基因用于分子系统学及种群遗传分析研究。 而以∞工部分基因作为DNA条形码进行品种鉴定研究的报道较少。本研究以6个地方鸡种为素 材，探讨利用COI基因的两段序列作为DNA条形码进行品种鉴定的可行性和有效性。 l材料与方法 1．1试验材料