微卫星标记BM1329在湘东黑山羊中的遗传多态性研究.pdfVIP

维普资讯 第 28卷第 5期 家畜生态学报 Vo1．28NO．5 2007年 9月 ActaEcologiaeAnimalisDomastici Sept．2007 微卫星标记 BM1329在湘东黑山羊 中的遗传多态性研究 黄生强 ，欧阳叙向 ，袁峥嵘 ，刘鹤翔 (1．湖南农业大学动物科学技术学院，湖南 长沙 410128；2．湖南生物机 电职业技术学院，湖南 长沙 41-0127) [摘 要] 利用经筛选的绵羊微卫星引物BM1329，采用聚丙烯酰胺凝胶垂直板电泳，对湘东 黑山羊的BM1329微卫星基因座进行 了多态性检测。结果表明：该基因座有8个等位基 因，其 片段大小在 l75bp一215bp之间，计算了该基 因座各等位基 因频率、基 因型频率及其平均基因 杂舍度(o．8305)、多态信息含量(o．8090)和有效等位基因数 (5．9001)。说明在湘东黑山羊中 微卫星标记 BM1329基 因座具有丰富的遗传多态性 ，可用于山羊遗传多态性的评估 ，也为山羊 的选育、保存和利用提供 了一定的科学理论依据。 [关键词] 微卫星标记；遗传 多态性 ；山羊 [中图分类号] $811．5 [文献标识码] A [文章编号] 1004—5228(2007)05—002i-04 微卫星 (Microsatellites)又称短串联重复序列 较晚，因此将微卫星标记用来分析 山羊的遗传多态 (shorttandem repeats，STRs)或称简单重复序列 性的国内报道相对更少 。本文 旨在研究湘东黑山羊 (simplesequencerepeats，SSRs)，是 2O世纪 8O年 品种内的遗传变异 ，以为该地方山羊品种的选育，保 代末期发展起来的一种新型 DNA标记。它是指以 存和利用提供有价值的科学理论依据。 少数几个核苷酸 (2～6bp)为单位多次串联重复的 1 材料与方法 DNA序列，微卫星随机地分布于真核生物基因组 中，在 DNA序列 中平均每 6Kb就可能有 出现一个 1．1 材料 (Bechmann等 ，1992)[1]。其多态信息含量高、重 1．1．1 样本的采集 及基因组 DNA 提取试验共 组率低 、检测相对容易、快速、准确 ，重复性好 ，结果 采集了湘东黑 山羊 l97头份的耳样 ，先取山羊耳组 便于分析。还可以跨物种使用，同时遵循孟德尔遗 织约0．5g，洗净 、去毛、切碎 ；加入 0．5mLDNA裂 传规律 ，具有复等位性和共显性等特点。因此被认 解液及0．1mg蛋白酶 K并混匀；置于 55℃摇床， 为是研究种群遗传变异最为理想 的分子标记，被广 转速 180r／min，消化约5h；加入等体积饱和酚 ，充 泛地应用于研究家畜标记基因图谱的构建、DNA指 分混匀，12000r／min离心 5rain，取上清液 ，重复 纹图的制作 、血缘或系谱鉴定和亲子鉴定、物种进化 抽提一次；加入等体积氯仿／异戊醇充分混匀 ，l2 演变和系谱确证 、QTL定位 ，保护遗传学等[2]。 000离心 5min，取上清液 ，重复抽提一次 ；加入两倍 本试验主要利用经筛选 的与多胎性 ]有关的微 体积的冷冻无水 乙醇 ，8000离心lrain，弃上清液 ； 卫星绵羊引物 BM1329，检测湘东黑山羊品种在该 干燥后加适量 TE溶解 ，紫外分光光度计检测浓度 位点的DNA多态性 ，预期得到该位点的各基 因型 后--20℃保存备用 ；对 DNA样品浓度和纯度的检 频率、各等位基因频率、多态信息含量、有效等位基