“组学”在微藻中的研究进展.pdfVIP

安徽农业科学 ，JoumalofAnhuiAgn．Sci．2010，38(15)：7761—7763，7778 责任编辑 刘 月娟 责任校对 卢瑶 “组学”在微藻 中的研究进展 张佳娣 (大连J：业大学生物与食品工程学院，辽宁大连l16o34) 摘要 将组学在微藻中的研究进展进行了综述，分别从基因组学、转录组学、蛋 白组学和代谢组学4个方面进行了阐述。 关键词 微藻；基因组学；转录组学；蛋白质组学；代谢组学 中图分类号 Q949．2 文献标识码 A 文章编号 0517—6611(2010)15—07761—03 Application ofOmiesinM icroalgaeResearch ZHANGJia-di (SchoolofBiological＆FoodEngineering，DalianPolytechnicUniversity，Dalian，Liaoning116034) Abstract Thecurrentstatusofomicsinalgaewasreviewedfrom genomics，transcriptomies，proteomicsand metabolomics Keywords M icroalgae；Genomics；Transcriptomic ；Proteomics；Metabolomics “组学”(Omics)是一种 比较新 的研究方法。在过去 的 前许多真核生物和原核生物 的基因序列 已经得到(http：／／ 10年间，它在生物学和生物医学研究 中起到很重要的作用。 www．genomesonline．org)。对藻类来说，对许多细胞器的基因 细胞中DNA首先转录成 mRNA，然后翻译成蛋 白质 ，最后酶 组已经进行了测序，同时对某些藻的全基因测序工作正在进 催化一系列反应 ，生成代谢物。在这些细胞活动中，组学技 行中。其中，莱茵衣藻是组学研究的模式藻株。莱茵衣藻是 术能提供全面的分析 ，使人们认识到细胞动态过程。基因组 一 种单细胞的淡水绿藻。它的全基因测序工作在 2003年 已 指一个细胞 中所有的DNA。与之类似 ，转录组、蛋白组和代 经完成 ，并在2007年发表 。在此期间，许多关于莱茵衣藻 谢组分别指细胞中所有转录过程的 RNA、蛋白质和代谢物。 各个细胞器官基因组和全基因组 的论文陆续发表 J。莱 而组学就是研究这些生物分子的一种方法。 茵衣藻的基因信息和 DNA微阵列技术 (Microarry)相结合 ， 早期的组学研究热点主要集中在细菌和哺乳动物上。 分析基因的功能。这也是蛋 白组学和代谢组学 的基础。举 这是因为这些研究能对人类的健康和生物医药的应用起重 例来说 ，在莱茵衣藻中对一些基因的注释 ，可以解释硝酸盐 要的作用。随后 ，对一些重要的生物系统也逐渐开始组学研 吸收的代谢途径 ，从而更好地帮助人们了解光合作用 ，也可 究，如微藻(Microalgae)。微藻指那些在显微镜下能辨认其 用于鉴别一些特定的代谢途径 ’” 。 形态的微小的藻类类群。许多微藻富含蛋 白质、多糖 、油脂 、 除了莱茵衣藻 ，也对其他微藻进行了基因组学的研究， 类胡萝 卜素和不饱和脂肪酸等生物活性物质，是重要的生物 Scala等对硅藻属的三角褐指藻 (Phaeodactylumtricornutum) 资源库 。微藻还是重要的生物能源原料 ，具有 巨大的生物 基因组性质进行了研究，发现60％的序列信息和数据库是一 质生产潜力。在同样条件下，微藻的生物质生产能力远远高 样的，另外约20％的基因功能表现在蛋白水平上有很大的相 于陆地植物 。它能够提供各种可再生生物燃料，如生物柴 似性 ，基因组的每个密码子位置、GC含量和拟南芥 比较类 油、甲烷和氢气、乙醇等。因此 ，微藻被认为是未来能源原料 似 。根据相同的思路 ，Ohta等研究了红藻(Cyanidioschy- 供应的重要来源 “。 zonn~erolae)的质体和全基因组” ”。在基因组学研究中， 组学是系统生物学 的重要组成部分。